Estudos genéticos sobre região do genoma da galinha doméstica com efeito pleiotrópico sobre o desempenho e a carcaça usando mapeamento por intervalo composto multivariado, mapeamento fino e testes de associação

• Processo: 10/50019-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2010
• Data de Término da vigência: 11 de setembro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Luiz Lehmann Coutinho
• Beneficiário: Millor Fernandes Do Rosário
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Avicultura Genômica Melhoramento genético Polimorfismo de um único nucleotídeo Locos de características quantitativas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Avicultura | Gene Candidato | Genomica | Melhoramento Genetico | Qtl | Snp

Resumo

A avicultura brasileira e mundial tem aprimorado os índices de desempenho devido principalmente ao melhoramento genético, que é baseado na estimação do valor genético através da avaliação de características quantitativas. Entretanto, é comum neste processo que a seleção não seja feita para cada característica isoladamente, devido à correlação genética. Esta tem como causas a pleiotropia ou a ligação genética, podendo ser estudada através da estratégia de mapeamento de QTLs pela implementação do mapeamento por intervalo composto multivariado. Além disso, muitas vezes o intervalo no qual se encontra o QTL cobre grandes extensões do cromossomo, o que dificulta a localização de genes candidatos por posição. Com a identificação de milhões de SNPs no genoma da galinha, tem sido também permitido desenvolver estratégias de mapeamento fino e de testes de associação. Em função da grande experiência e resultados acumulados durante a execução do Projeto Genoma Brasileiro da Galinha, uma iniciativa entre a EMBRAPA Suínos e Aves e a ESALQ/USP, este projeto tem o objetivo geral identificar e estudar uma região genômica da galinha doméstica que possui efeito pleiotrópico sobre características de desempenho e carcaça. Para tanto, os objetivos específicos são: 1) implementar o mapeamento por intervalo composto multivariado (multiCIM); 2) analisar os dados já obtidos na população TCTC com marcadores microssatélites empregando o multiCIM; 3) selecionar uma região de QTL com efeito pleiotrópico; 4) adensar esta região selecionada com 20 SNPs associados a genes candidatos por posição e função; 5) empregar o mapeamento fino usando o multiCIM, incluindo microssatélites e SNPs; 6) testar a associação entre SNPs e fenótipos. Com a integração dos resultados destas três estratégias genômicas, espera-se que a pleiotropia possa ser mais bem compreendida, podendo ser de grande utilidade para estudos básicos de genética e para os programas de melhoramento genético avícolas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ROSARIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F.. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 55, n. 1, p. 97-103, FEB 2014. (04/02080-2, 10/50019-1, 12/13272-6)