Código estereoquímico no processo de folding de macromoléculas

• Processo: 99/08947-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 1999
• Data de Término da vigência: 16 de setembro de 2001
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada
• Pesquisador responsável: Antonio Caliri
• Beneficiário: Alessandro Danilo Figueiredo Padua
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Proteínas Macromolécula Método de Monte Carlo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Codico Estereoquimico | Folding | Hidrofobicidade | Macromoleculas | Proteinas | Simulacao

Resumo

Este projeto visa estudar a complementaridade dos aminoácidos naturais (hidrofóbicos), responsável pelo alto grau de compactação das proteínas globulares. O trabalho envolve, a seleção de proteínas globulares (mínimo de 60 cadeias de 50 aminoácidos), cuja estrutura tridimensional tenha sido determinada. Através-de análises, se buscará relacionar freqüência de pares de aminoácidos em contato e grau de ajustamento (fitting) espacial, no intento de se obter um conjunto de "objetos geométricos" simples que, uma vez adicionadas características químicas pertinentes, se constituirão num "código estereoquímico" importante em aplicações da simulação Monte Cario do processo de folding de macromoléculas. Relativamente a recursos humanos, nosso objetivo é contribuir no aprimoramento de alunos da Faculdade de Ciências Farmacêuticas, somando à sua formação, idéias, conceitos e técnicas das áreas da física, matemática e computação, com vistas a uma farmacêutica moderna. (AU)