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Mapeamento de ilhas de transferência gênica em Xanthomonas axonopodis pv citri e Xanthomonas campestris pv campestris

Processo: 01/12578-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2002
Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2007
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Carlos Frederico Martins Menck
Beneficiário:Wanessa Cristina de Lima
Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Analise Filogenetica | Conteudo Nucleotidico | Xanthomonas

Resumo

Este trabalho tem por objetivo a identificação de possíveis eventos de transferência genética horizontal nos genomas de Xanthomonas axonopodis pv CITRI e de Xanthomonas campestris pv CAMPESTRIS, com o uso de ferramentas de bioinformática, tais como: análise de 'best hit', análise de conteúdo genômico e de padrões de distribuição de genes, e construção de árvores filogenéticas. Análises preliminares indicam que aproximadamente 40% do genoma de Xanthomonas pode ser resultante de eventos de transferência lateral, e esse trabalho tem por objetivo a confirmação desses dados através de análises mais acuradas. (AU)

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