Caracterização genômica e funcional de sequências relacionadas ao retrotransposon Tnt1 em cana-de-açúcar

• Processo: 03/13608-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2004
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2009
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Douglas Silva Domingues
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Retroelementos Cana-de-açúcar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana-De-Acucar | Caracterizacao Funcional | Caracterizacao Genomica | Elementos De Transposicao | Retrotransposon | Tnt1

Resumo

Os elementos transponíveis (TEs) representam uma grande porcentagem dos genomas vegetais. Com o surgimento dos projetos genoma, houve um aumento nas informações disponíveis sobre TEs, que possibilitou o desenvolvimento de novas abordagens no estudo destes elementos. O SUCEST gerou um grande volume de informações a respeito dos TEs expressos em cana-de-açúcar. Estes dados deram o suporte necessário para estudos detalhados sobre as famílias de TEs neste gênero. O retrotransposon Tnt1, que parecia estar restrito apenas à família Solanaceae, teve elementos similares em nível de aminoácidos identificados em algumas monocotiledôneas, entre elas a cana-de-açúcar. Este projeto tem como objetivo a caracterização genômica e funcional das seqüências de cana-de-açúcar relacionadas ao elemento Tnt1. Estudos sobre a distribuição dessas seqüências no genoma, análises de expressão e filogenia irão proporcionar uma avaliação detalhada destes retrotransposons relacionados à Tnt1. Estes dados possibilitarão a identificação de regiões conservadas e padrões de expressão que sejam comuns aos elementos de cana-de-açúcar e fumo. As informações geradas serão importantes para elucidar a evolução, atividade e dispersão destes elementos relacionados à Tnt1 em monocotiledôneas, utilizando a cana-de-açúcar como planta modelo. Esta será uma contribuição importante para o entendimento do impacto e da distribuição dos TEs nos genomas vegetais. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

DOMINGUES, Douglas Silva. SURE e Garapa: caracterização molecular e distribuição de dois retrotransposons com LTR em cana-de-açúcar.. 2009. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.