Estudos da expressão diferencial de genes em câncer coloretal

Autor(es)

Nidia Alice Pinheiro

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ)
• Data de defesa: 2001-10-01

Membros da banca

Ricardo Renzo Brentani; Hamza Fahmi Ali El Dorry; Bryan Eric Strauss; Sergio Verjovski Almeida; Marco Antonio Zago; Bianca Silvana Zingales

• Orientador: Ricardo Renzo Brentani

Resumo

A tumorigênese do cólon é considerada como um processo complexo que ocorre em múltiplos passos, através de uma série de mutações gênicas capazes de promover a evolução de uma lesão precursora até um adenocarcinoma invasivo e metastático. O desenvolvimento e progressão do câncer e a reversão da tumorigenicidade são acompanhados por complexas mudanças no padrão da expressão gênica. Microarrays de cDNAs fornecem um poderoso instrumento para se estudar esses complexos fenômenos. O propósito deste estudo foi o de determinar a expressão diferencial de genes em tumores coloretais em comparação aos seus tecidos normais. Nós também investigamos a possível variabilidade da expressão gênica entre misturas de tumores coloretais microdissecados. Essas amostras foram analisadas usando o sistema Gene Discovery Array Human System (Incyte Genomics) que consiste de duas membranas de nylon com clones de cDNA fixados em duplicatas, em uma densidade de 36,864 clones por filtros ou 18,376 clones de cDNA individuais. Nossos resultados mostraram vários clones diferencialmente expressos entre os tecidos tumorais e normais analisados. Os resultados obtidos com membranas GDA foram comparados através de um programa de computador na linguagem UNIX aos dados publicados por Alon et al., 1999, que trabalharam com o sistema \"Affymetrix Oligonucleotide Array\" com complementariedade para mais que 6,500 genes humanos. Os resultados encontrados nessas análises foram contrastados com os presentes nas bibliotecas de SAGE, através do instrumento \"Northern Virtual\" presente na página \"Sagenet.org\" . Alguns dos genes diferencialmente expressos encontrados neste estudo foram analisados pela técnica de RT-PCR semiquantitativa em tumores coloretais individuais. (AU)

• Processo FAPESP: 98/00170-1 - Influencia de mutacoes no gene supressor de tumor p53 na expressao genica em tumores coloretais.
• Beneficiário: Nídia Alice Pinheiro
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado