Análise da expressão diferencial de proteínas em ilhas neoplásicas grandes e pequenas por espectrometria de massas baseada em proteômica e sua relação com o prognóstico

Autor(es)

Carolina Carneiro Soares Macedo

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: Piracicaba, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Odontologia de Piracicaba
• Data de defesa: 2015-07-30

Membros da banca

Adriana Franco Paes Leme; Eloiza Helena Tajara da Silva; Marcelo Rocha Marques

• Orientador: Ricardo Della Coletta; Adriana Franco Paes Leme

Resumo

O carcinoma espinocelular oral (CEC) é o tipo de neoplasia maligna mais comum em cabeça e pescoço, com alta prevalência e morbidade. O tratamento é baseado em sistemas de classificação pouco precisos e o prognóstico é ruim em muitos casos. Diferentes padrões histológicos já foram descritos na tentativa de melhor compreender o curso da doença, predizer prognóstico e auxiliar no tratamento. As diferentes áreas do tumor apresentam características morfológicas e moleculares distintas resultando em comportamentos clínicos específicos, e estudos recentes apontam a região de invasão tumoral (do inglês invasive front tumor) como área de interesse para análises de perfil molecular e identificação de possíveis marcadores de prognóstico. O padrão de invasão neoplásico tem relação com a agressividade tumoral e a presença de ilhas no fronte invasivo já foi descrita como pior padrão. Assim, o objetivo desta dissertação foi comparar a composição diferencial de proteínas totais de ilhas neoplásicas grandes e pequenas do fronte e do interior do tumor, e correlacionar essas proteínas com o prognóstico. A proteômica foi associada à microdissecção a laser (ML), consideradas juntas como ferramentas de alta robustez para identificação de proteínas em tecidos neoplásicos em regiões específicas. Vinte peças cirúrgicas de CEC oral de língua fixadas em parafina foram submetidas a ML para obtenção das amostras compostas pelas seguintes regiões do tecido: 1) ilhas neoplásicas grandes da região frontal, 2) ilhas neoplásicas pequenas da região frontal, 3) ilhas neoplásicas grandes do interior do tumor e 4) ilhas neoplásicas pequenas do interior do tumor, seguida pela extração de proteínas e análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS). A anotação funcional das proteínas e a correlação aos dados clínico-patológicos dos pacientes foram realizadas. Foram identificadas 1906 proteínas totais, sendo 1480 proteínas comuns entre as quatros regiões estudadas. Duas proteínas foram exclusivas nas ilhas grandes do fronte e sete nas ilhas grandes do interior. Oitenta e cinco proteínas foram diferencialmente expressas entre a região do fronte e o interior tumoral, e destas, 57 foram relacionadas a dados clínico-patológicos importantes para o prognóstico. Os processos biológicos, como desenvolvimento da epiderme, adesão celular, apoptose, ciclo celular, degradação da matriz extracelular e expressão gênica, evidenciados entre as proteínas diferencialmente expressas confirmam as mudanças moleculares associadas à progressão neoplásica. A combinação de ML, MS e bioinformática foi capaz de identificar um painel de proteínas que podem auxiliar a desvendar o curso do CEC oral, predizendo agressividade e prognóstico. Em acréscimo, essa abordagem pode ajudar ainda na compreensão das diferenças e dos mecanismos de sinalização entre diferentes áreas do tecido (AU)

• Processo FAPESP: 14/02288-4 - Análise da expressão diferencial de proteínas em ilhas neoplásicas grandes e pequenas por espectrometria de massas baseada em proteômica e sua relação com o prognóstico
• Beneficiário: Carolina Carneiro Soares Macedo
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado