Identificação dos fatores de virulência da Leptospira interrogans através de análises proteômicas comparativas

Autor(es)

Edson Galdino do Nascimento Filho

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI)
• Data de defesa: 2022-10-13

Membros da banca

Ana Lucia Tabet Oller do Nascimento; Wagner Luiz Batista; Cristiane Rodrigues Guzzo Carvalho; Júlia Pinheiro Chagas da Cunha; Nilmar Sílvio Moretti; Patrícia Severino

• Orientador: Ana Lucia Tabet Oller do Nascimento; Daniel Carvalho Pimenta

Resumo

Leptospira é um gênero de bactérias espiroquetas que inclui espécies saprofíticas ou não patogênicas de vida livre encontradas em água ou solo, e espécies patogênicas, que são os agentes etiológicos da leptospirose. Esta doença é uma zoonose de incidência global, ocorrendo principalmente em países tropicais e subtropicais. A leptospirose pode ser assintomática ou sintomática com quadros clínicos variáveis nos seres humanos. Os determinantes de virulência e patogenicidade das leptospiras ainda permanecem pouco compreendidos. Em vista disso, foi realizada uma análise global das proteínas expressas na espécie saprofítica, L. biflexa, para comparar com o proteoma da espécie patogênica, L. interrogans, disponível na literatura. A partir desta análise comparativa, o objetivo principal seria reconhecer os potenciais alvos envolvidos na virulência e patogênese da L. interrogans. Foram identificadas 2.327 proteínas por espectrometria de massas na L. biflexa representando 64% das proteínas preditas no genoma desta bactéria. As proteínas identificadas nas duas espécies apresentaram uniformidade funcional pelo software COG. Aproximadamente 80% das proteínas tiveram localizações subcelulares definidas pelo software PSORTb, e 21% das proteínas apresentaram peptídeos sinais de exportação pelos softwares SignalP e LipoP. As vias metabólicas do complexo B (B1, B2, B6, B7 e B9) foram identificadas nas duas espécies de leptospiras, já as vias B12 e do ácido siálico apenas na espécie patogênica. Também foram identificadas as proteínas ortólogas e exclusivas nas duas espécies de leptospiras pelo software Get Homologues. As proteínas ortólogas foram posteriormente classificadas como pouco conservadas e conservadas. Destas análises, selecionaram-se apenas as proteínas pouco conservadas e as proteínas exclusivas da L. interrogans para serem melhor investigadas conforme os resultados obtidos sobre função biológica (COG), localização subcelular (PSORTb e CELLO) e peptídeo sinal de exportação (SignalP e LipoP), juntamente das análises de domínios estruturais pelos softwares Pfam e SMART. Um total de 1.109 proteínas foi previamente selecionado na L. interrogans. Deste total, selecionamos 738 proteínas com domínios estruturais (108 pouco conservadas e 93 exclusivas) e 123 proteínas sem domínios estruturais (59 pouco conservadas e 64 exclusivas). Estas últimas foram baseadas exclusivamente em suas localizações como proteínas de membrana externa, extracelulares e proteínas sem localização definida. Segundo esses critérios, temos 861 proteínas selecionadas como potencias alvos envolvidos na virulência das leptospiras patogênicas. (AU)

• Processo FAPESP: 18/06201-1 - Identificação dos fatores de virulência da Leptospira interrogans através de análises proteômicas comparativas
• Beneficiário: Edson Galdino Do Nascimento Filho
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado