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Marie-Anne van Sluys

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências (IB)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ) em 1983 e o título de Doutor pela Université Paris XI (Centre d?Orsay, França) em 1989. É professora titular do Departamento de Botânica da Universidade de São Paulo desde 2007. Dois interesses principais orientam a sua atuação acadêmica-científica e são eles a compreensão de processos moleculares para diversificação biológica e a interação entre plantas e microrganismos. Estes interesses direcionaram a atuação do grupo GaTE em genômica comparativa e função biológica dos elementos de transposição. É membro da ACIESP (2015-atual), ABC (2016-atual) e CDES (2016-2018). Mais de 50 profissionais em diferentes estágios de formação científica passaram pelo GaTE e encontram-se inseridos no setor público e privado no Brasil e no exterior. (Fonte: Currículo Lattes)

Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o(a) pesquisador(a):
La caña de azúcar mapeada 
La caña de azúcar mapeada 
DNA cigano 
El ADN gitano 
Matéria(s) publicada(s) no Pesquisa para Inovação FAPESP sobre o(a) pesquisador(a):
Biotecnologia pode tornar agricultura resiliente às mudanças no clima 
Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o(a) pesquisador(a)
TITULO 
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Auxílios à pesquisa
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  • Resumo

    Representar a FAPESP na iniciativa coordenada pelo FFAR. A colaboração Internacional para Agricultura do Futuro pretende estabelecer uma parceria internacional entre agências de fomento a pesquisa, empresas e instituições de pesquisa em área interdisciplinar cominando agronomia, abordagens"ômicas", genética e fisiologia vegetal além de data science para uma agricultura do futuro sustentáv…

    Colaboração Internacional para Agricultura do Futuro, AP.R
  • International Plant & Animal Genome XXV, AR.EXT

  • Resumo

    O objetivo da presente solicitação é a consolidação da parceria entre a BSSB e o centro irmão WISB. Em 2014, realizamos um simpósio na USP em que BSSB, WISB e CoSBi (centro correlato na Boston University) fizeram apresentações de seus projetos em andamento. Além destes, UPF (Barcelona) e CNB (Madrid) foram convidados a fazer parte desta roda de Biologia Sintética. A partir da presente sol…

    Extending synthetic biology collaborations between WISB and BSSB, AP.R SPRINT
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  • Resumo

    Elementos móveis possuem um grande potencial de influência na evolução de genomas bacterianos. São integrantes importantes do processo de geração da variabilidade genética, promovendo a diversidade da população frente à estocasticidade do ambiente. Meu projeto de Doutorado investiga como os elementos genéticos móveis influenciaram a história evolutiva da linhagem de bactérias fitopatogêni…

    Influência de elementos móveis em linhagens de Xanthomonas oryzae, BE.EP.DR

  • Resumo

    Cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma monocotiledônea de metabolismo C4 e é uma uma importante cultura tropical cultivada para a produção de sacarose. O gene thi1 foi o primeiro gene a ser reportado da rota da biossíntese de tiamina em plantas. A proteína THI1 é conhecida por estar envolvida na síntese do anel de tiazol, um componente da tiamina (Vitamina B1), que é um co-fator essencial …

    Construção de plantas modelo para o estudo funcional de variantes do gene THI1 de cana-de-açúcar, BE.EP.DD

  • Resumo

    O complexo Saccharum (Poaceae) compõe uma das espécies mais importantes devido à sua dominância ecológica e importância agrícola e econômica. Cultivares modernas de cana-de-açúcar são híbridos derivados de cruzamentos entre S. officinarum e S. spontaneum. Estas cultivares exibem entre 100 e 130 cromossomos, com contribuições desiguais dos genomas parentais. Possuem genomas grandes (~10Gb)…

    Dinâmica evolutiva e distribuição cromossômica de repetições teloméricas em cromossomos de Saccharum spp, BE.EP.PD
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Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 23/10/2021
3 Auxílios à pesquisa em andamento
18 Auxílios à pesquisa concluídos
3 Bolsas no país em andamento
59 Bolsas no país concluídas
4 Bolsas no exterior concluídas
87 Todos os Auxílios e Bolsas
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Agricultura sustentável Agricultura Agronomia Análise de sequência de DNA Análise do polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados Análise morfológica Anemopaegma Angiospermas Apoptose Arabidopsis thaliana Arroz Bactérias Banco de dados Bignoniaceae Biocombustíveis Biodiversidade Bioenergia Biologia Geral Biologia Molecular Biologia computacional Biologia do desenvolvimento Biologia e Fisiologia dos Microorganismos Biologia molecular vegetal Biologia molecular Biologia sintética Bioquímica Biotecnologia Botânica Cana-de-açúcar Caracterização molecular Caule Ciclo celular Ciência de dados Ciências Biológicas Citogenética Clonagem Clorose variegada dos citros Combustíveis Cultura de células DNA Dano ao DNA Densidade Desenvolvimento vegetal Elementos de DNA transponíveis Enzimologia Epigênese genética Equipamentos multiusuários Escaldadura da folha Espécies de oxigênio reativas Estágios de desenvolvimento Estudo comparativo Etanol Etiquetas de sequências expressas Eventos científicos e de divulgação Expressão de proteínas Expressão gênica Extração de DNA Fator de transcrição TFIIH Fatores bióticos Fenótipo Fisiologia vegetal Fitopatologia Fluorescência Fumo Genes Genética Molecular e de Microorganismos Genética Vegetal Genética molecular vegetal Genética molecular Genética Genoma Cana-de-Açúcar - SucEST Genoma Xylella fastidiosa Genomas Agronômicos e Ambientais - AEG Genomas Genômica comparativa Genômica Genótipo Gluconacetobacter xylinus Gluconacetobacter Imagem Inativação gênica Inovações tecnológicas Interação planta-inseto Interação planta-patógeno Interações hospedeiro-patógeno Interdisciplinar Interferência de RNA Leifsonia xyli Leveduras Mapeamento genético Marcador molecular Melhoramento genético Metabolismo energético Micro-organismos Microbiologia Aplicada Microbiologia Microbiota Microscopia de fluorescência Microscopia Milho Mineração de dados Mitocôndrias Montagem Mutagênese Oxigênio singleto Parede celular Patentes Physcomitrella patens Pirosequenciamento Plantas geneticamente modificadas Plantas trepadeiras Plantas Poaceae Polimorfismo genético Proteínas de Arabidopsis Quantificação RNA longo não codificante Raios ultravioleta Raquitismo das soqueiras Reação em cadeia da polimerase em tempo real Reação em cadeia por polimerase (PCR) Recombinação genética Regiões promotoras genéticas Regulação da expressão gênica Reparo do DNA Retroelementos Reuniões científicas Sacarose Saccharomyces cerevisiae Saccharum Sequenciamento Solanaceae Sporisorium scitamineum Tabacum Taxonomia Vegetal Tecidos vegetais Técnicas in vitro Tiamina Tiazóis Transcrição genética Transcriptoma Transformação genética Xanthomonas Xylella fastidiosa
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (24)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações26
Citações194
Cit./Artigo7,5
Dados do Web of Science

NAGEL, RAIMUND; TURRINI, PAULA C. G.; NETT, RYAN S.; LEACH, JAN E.; VERDIER, VALERIE; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; PETERS, REUBEN J.. An operon for production of bioactive gibberellin A(4) phytohormone with wide distribution in the bacterial rice leaf streak pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzicola. NEW PHYTOLOGIST, v. 214, n. 3, SI, p. 1260-1266, . Citações Web of Science: 10. (12/24954-0, 15/24956-1, 08/52074-0)

FIRETTI, FABIANA; ZUNTINI, ALEXANDRE RIZZO; GAIARSA, JONAS WEISMANN; OLIVEIRA, RENATA SOUZA; LOHMANN, LUCIA G.; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Complete chloroplast genome sequences contribute to plant species delimitation: A case study of the Anemopaegma species complex. AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, v. 104, n. 10, p. 1493-1509, . Citações Web of Science: 8. (12/50260-6, 08/52074-0, 11/50859-2, 13/10362-7)

PETERS, L. P.; TEIXEIRA-SILVA, N. S.; BINI, A. P.; SILVA, M. M. L.; MORAES, N.; CRESTANA, G. S.; CRESTE, S.; AZEVEDO, R. A.; CARVALHO, G.; MONTEIRO-VITORELLO, C. B.. Differential responses of genes and enzymes associated with ROS protective responses in the sugarcane smut fungus. FUNGAL BIOLOGY, v. 124, n. 12, p. 1039-1051, . Citações Web of Science: 1. (17/13268-2, 13/15014-7, 16/17545-8, 18/07615-4, 16/16376-8)

FARIA, RAPHAEL S. C. A.; CIA, MARIANA C.; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.; AZEVEDO, RICARDO A.; CAMARGO, LUIS EDUARDO A.. Characterization of genes responsive to osmotic and oxidative stresses of the sugarcane bacterial pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Brazilian Journal of Microbiology, v. 51, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (15/18681-0, 16/17545-8)

RODY, HUGO V. S.; BOMBARDELLI, RENATO G. H.; CRESTE, SILVANA; CAMARGO, LUIS E. A.; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. Genome survey of resistance gene analogs in sugarcane: genomic features and differential expression of the innate immune system from a smut-resistant genotype. BMC Genomics, v. 20, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (18/04555-0, 16/17545-8)

MEDEIROS, AMANDA L.; FURTADO, CRISTIANE M.; LEITE, FRANCINALDO S.; SOUTO, VALESKA S.; DE SETTA, NATHALIA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; KITAJIMA, JOAO PAULO; COSTA, ANA PAULA P.; BENEDITO, VAGNER A.; SCORTECCI, KATIA C.. Molecular Genetic Dissection of Sugarcane Flowering under Equatorial Field Conditions. TROPICAL PLANT BIOLOGY, v. 9, n. 4, p. 252-266, . Citações Web of Science: 1. (08/52074-0)

OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRES; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELLO; VIEIRA, ANDREIA PRATA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-like attachment sites as structural landmarks of plants retrotransposons. MOBILE DNA, v. 7, . Citações Web of Science: 0. (12/21064-4, 08/58243-8, 12/02671-7, 08/52074-0)

CRUZ, GUILHERME M. Q.; METCALFE, CUSHLA J.; DE SETTA, NATHALIA; CRUZ, EDGAR A. O.; VIEIRA, ANDREIA PRATA; MEDINA, ROSARIO; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-Like Attachment Sites and Plastic CpG Islands: Landmarks of Diversity in Plant Del Retrotransposons. PLoS One, v. 9, n. 5, . Citações Web of Science: 2. (09/51632-1, 08/58243-8, 09/09217-7, 12/14610-2, 08/52074-0, 12/02671-7)

TANIGUTI, LUCAS M.; SCHAKER, PATRICIA D. C.; BENEVENUTO, JULIANA; PETERS, LEILA P.; CARVALHO, GISELLE; PALHARES, ALESSANDRA; QUECINE, MARIA C.; NUNES, FILIPE R. S.; KMIT, MARIA C. P.; WAI, ALVAN; et al. Complete Genome Sequence of Sporisorium scitamineum and Biotrophic Interaction Transcriptome with Sugarcane. PLoS One, v. 10, n. 6, . Citações Web of Science: 38. (14/17034-8, 13/15014-7, 12/09524-0, 13/25599-2, 10/05591-9, 14/21802-0, 08/52074-0)

METCALFE, CUSHLA J.; OLIVEIRA, SARAH G.; GAIARSA, JONAS W.; AITKEN, KAREN S.; CARNEIRO, MONALISA S.; ZATTI, FERNANDA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Using quantitative PCR with retrotransposon-based insertion polymorphisms as markers in sugarcane. Journal of Experimental Botany, v. 66, n. 14, SI, p. 4239-4250, . Citações Web of Science: 4. (13/18322-4, 08/52074-0, 13/09391-2, 09/09217-7)

DE SETTA, NATHALIA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; CAPY, PIERRE; APARECIDA CARARETO, CLAUDIA MARCIA. Copia Retrotransposon in the Zaprionus Genus: Another Case of Transposable Element Sharing with the Drosophila melanogaster Subgroup. Journal of Molecular Evolution, v. 72, n. 3, p. 326-338, . Citações Web of Science: 4. (04/02851-9)

DE SETTA, NATHALIA; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA BARROS; METCALFE, CUSHLA JANE; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELO; DEL BEM, LUIZ EDUARDO; VICENTINI, RENATO; SILVEIRA NOGUEIRA, FABIO TEBALDI; CAMPOS, ROBERTA ALVARES; NUNES, SIDENY LIMA; GASPERAZZO TURRINI, PAULA CRISTINA; et al. Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. BMC Genomics, v. 15, . Citações Web of Science: 50. (10/05591-9, 09/09116-6, 11/05317-7, 08/52197-4, 09/09217-7, 08/52146-0, 08/52074-0, 08/58031-0, 08/54201-9, 08/58243-8, 09/51632-1)

BENEVENUTO, JULIANA; TEIXEIRA-SILVA, NATALIA S.; KURAMAE, EIKO E.; CROLL, DANIEL; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. Comparative Genomics of Smut Pathogens: Insights From Orphans and Positively Selected Genes Into Host Specialization. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 9, . Citações Web of Science: 5. (14/21802-0, 17/13268-2, 16/16376-8, 16/03768-5, 16/17545-8)

SCHAKER, PATRICIA D. C.; PALHARES, ALESSANDRA C.; TANIGUTI, LUCAS M.; PETERS, LEILA P.; CRESTE, SILVANA; AITKEN, KAREN S.; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; KITAJIMA, JOAO P.; VIEIRA, MARIA L. C.; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. RNAseq Transcriptional Profiling following Whip Development in Sugarcane Smut Disease. PLoS One, v. 11, n. 9, . Citações Web of Science: 9. (10/05591-9, 14/17034-8, 15/07112-4, 12/09524-0, 13/25599-2)

BARROS-CARVALHO, GESIELE ALMEIDA; HUNGRIA, MARIANGELA; LOPES, FABRICIO MARTINS; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Brazilian-adapted soybean Bradyrhizobium strains uncover IS elements with potential impact on biological nitrogen fixation. FEMS Microbiology Letters, v. 366, n. 11, . Citações Web of Science: 0. (08/52074-0)

DOMINGUES, DOUGLAS S.; CRUZ, GUILHERME M. Q.; METCALFE, CUSHLA J.; NOGUEIRA, FABIO T. S.; VICENTINI, RENATO; ALVES, CRISTIANE DE S.; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Analysis of plant LTR-retrotransposons at the fine-scale family level reveals individual molecular patterns. BMC Genomics, v. 13, . Citações Web of Science: 33. (08/52074-0)

DE SETTA, NATHALIA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; CAPY, PIERRE; CARARETO, CLAUDIA M. A.. Multiple invasions of Gypsy and Micropia retroelements in genus Zaprionus and melanogaster subgroup of the genus Drosophila. BMC Evolutionary Biology, v. 9, . Citações Web of Science: 11. (04/02851-9)

MANETTI, M. E.; ROSSI, M.; NAKABASHI, M.; GRANDBASTIEN, M. A.; VAN SLUYS, MARIE ANNE. The Tnt1 family member Retrosol copy number and structure disclose retrotransposon diversification in different Solanum species. Molecular Genetics and Genomics, v. 281, n. 3, p. 261-271, . Citações Web of Science: 6. (08/55646-4)

ZERILLO, MARCELO M.; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; CAMARGO, LUIS EDUARDO A.; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. Characterization of new IS elements and studies of their dispersion in two subspecies of Leifsonia xyli. BMC Microbiology, v. 8, . Citações Web of Science: 8. (04/02851-9)

MENOSSI, M.; SILVA-FILHO, M. C.; VINCENTZ, M.; VAN-SLUYS, M.-A.; SOUZA, G. M.. Sugarcane functional genomics: gene discovery for agronomic trait development. International Journal of Plant Genomics, v. 2008, . (04/02851-9)

MENOSSI, M.; SILVA-FILHO, M. C.; VINCENTZ, M.; VAN-SLUYS, M.-A.; SOUZA, G. M.. Sugarcane functional genomics: gene discovery for agronomic trait development. International Journal of Plant Genomics, v. 2008, . (04/02851-9)

TEIXEIRA-SILVA, NATALIA SOUSA; CARVALHO SCHAKER, PATRICIA DAYANE; SILVA RODY, HUGO VIANNA; MAIA, THIAGO; GARNER, CHRISTOPHER M.; GASSMANN, WALTER; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA BARROS. Leaping into the Unknown World of Sporisorium scitamineum Candidate Effectors. JOURNAL OF FUNGI, v. 6, n. 4, . Citações Web of Science: 1. (17/13268-2, 16/04429-0, 16/16376-8, 13/25599-2, 18/04555-0, 16/17545-8, 17/25477-5)

SOUZA, GLAUCIA MENDES; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LEE, HAYAN; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES; HOTTA, CARLOS TAKESHI; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; DINIZ, AUGUSTO LIMA; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS; FERREIRA, SAVIO DE SIQUEIRA; et al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GIGASCIENCE, v. 8, n. 12, . Citações Web of Science: 3. (12/51062-3, 11/50761-2, 13/23048-9, 13/07467-1, 08/52074-0, 17/02270-6, 15/15346-5, 14/50921-8, 15/22993-7, 17/02842-0, 13/18322-4, 08/52146-0, 16/17545-8, 16/06917-1)

RODY, HUGO V. S.; CAMARGO, LUIS E. A.; CRESTE, SILVANA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; RIESEBERG, LOREN H.; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. Arabidopsis-Based Dual-Layered Biological Network Analysis Elucidates Fully Modulated Pathways Related to Sugarcane Resistance on Biotrophic Pathogen Infection. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, . Citações Web of Science: 0. (19/13530-4, 18/04555-0, 16/17545-8)

MASUDA, HANA PAULA; NAKABASHI, MYNA; MORGANTE, PATRICIA G.; KAJIHARA, DANIELA; DE SETTA, NATHALIA; MARTINS MENCK, CARLOS FREDERICO; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. Gene, v. 754, . Citações Web of Science: 0. (05/56548-8, 06/61559-1, 14/15982-6, 09/52417-7, 98/00004-4, 02/02655-0, 98/03925-3)

PARTIDA, VANIA GABRIELA SEDANO; DIAS, HENRIQUE MOURA; CORCINO, DIANA SUSANA MARTINEZ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Sucrose-phosphate phosphatase from sugarcane reveals an ancestral tandem duplication. BMC PLANT BIOLOGY, v. 21, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (16/17545-8, 18/10746-3)

CRESTANA, GUSTAVO SCHIAVONE; TANIGUTI, LUCAS MITSUO; DOS SANTOS, CLESIVAN PEREIRA; BENEVENUTO, JULIANA; CERESINI, PAULO CEZAR; CARVALHO, GISELLE; KITAJIMA, JOAO PAULO; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA BARROS. Complete Chromosome-Scale Genome Sequence Resource for Sporisorium panici-leucophaei, the Causal Agent of Sourgrass Smut Disease. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 34, n. 4, p. 448-452, . Citações Web of Science: 0. (18/24028-5, 17/13268-2, 16/17545-8)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MOMOLI, Marisa Moura. Aspectos funcionais do gene thi1 em plantas selvagens e mutantes de Arabidopsis thaliana (Brassicaceae).  139 f. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biociências.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (05/56276-8) 

JESUS, Érika Maria de. Estudo de dois grupos de elementos de cana-de-açúcar homológos à superfamília hAT de transposons. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biociências.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (03/13525-2) 

KAROLSKI, Bruno. Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biociências.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (04/04088-0) 

NAKABASHI, Myna. Genes paralogos AtXPB1 e AtXPB2: estudo da duplicação e expressão em Arabidopsis thaliana.  111 f. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biociências.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (02/02655-0) 

ISHIDA, Juliane Karine. Estudo do perfil transcricional do retrotransposon Retrolyc1 em mutantes de tomate Micro-Tom e em suspensão celular de fumo. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biociências.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (05/57923-7) 

Patente(s) depositada(s)

RETROPROM, MÉTODO DE OBTENÇÃO DE RETROPROM E USO DE RETROPROM PI0405412-1 - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Universidade de São Paulo (USP). Marie-Anne Van Sluys; Maria Magdalena Rossi; Paula Gonçalves de Araujo - 27 de outubro de 2004

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