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Controle redox de expressão gênica: caracterização de redes regulatórias e seu envolvimento na diferenciação de células-tronco (stem cells)

Processo: 02/01826-5
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2002
Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2006
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Oswaldo Keith Okamoto
Beneficiário:Oswaldo Keith Okamoto
Instituição Sede: Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein (IIEPAE). Sociedade Beneficente Israelita Brasileira Albert Einstein (SBIBAE). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):02/09968-3 - Controle redox de expressão gênica: caracterização de redes regulatórias e seu envolvimento na diferenciação de células-tronco (stem cells), BP.JP
Assunto(s):Células-tronco  Expressão gênica 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Celulas-Tronco | Expressao Genica | Genomica Funcional | Microarrays
Publicação FAPESP:https://media.fapesp.br/bv/uploads/pdfs/Investindo...pesquisadores_93_104_104.pdf

Resumo

Neste projeto, pretende-se investigar os eventos moleculares associados a perpetuação e diferenciação de células-tronco (stem cells) em estudos de genômica funcional. Uma vez que esta diferenciação é modulada pelo estado redox celular, parte-se do princípio que espécies reativas de oxigênio e nitrogênio (ERO/ERN) ativam vias de sinalização e/ou eventos transcricionais específicos, culminando na regulação da expressão de grupos de genes (regulons), os quais podem exercer importante função neste processo celular. Assim, propomos a caracterização de padrões globais de expressão gênica em células indiferenciadas e diferenciadas, expostas a ERO e ERN, visando à identificação de genes cuja expressão é alterada nas distintas condições experimentais. Este papel sinalizador das ERO/N será investigado através das oscilações que estas causam no transcriptoma de células-tronco, como as derivadas de cordão umbilical e tecido germinativo embrionário, utilizando cDNA microarrays. Propomos ainda uma análise dos promotores dos genes redox-regulados na busca de elementos cis associados a fatores de transcrição que, juntamente aos seus genes-alvo, servirão de substrato para a elaboração de redes regulatórias transcricionais. Esta organização hierárquica auxiliará na compreensão dos sinais de ativação, elementos regulatórios e genes envolvidos na diferenciação de células-tronco. (AU)

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Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OKAMOTO, OSWALDO K.; JANJOPPI, LUCIANA; BONONE, FELIPE M.; PANSANI, ALINE P.; DA SILVA, ALEXANDRE V.; SCORZA, FULVIO A.; CAVALHEIRO, ESPER A.. Whole transcriptome analysis of the hippocampus: toward a molecular portrait of epileptogenesis. BMC Genomics, v. 11, . (02/01826-5)
PAVON, L. F.; GAMARRA, L. F.; MARTI, L. C.; AMARO JUNIOR, E.; MOREIRA-FILHO, C. A.; CAMARGO-MATHIAS, M. I.; OKAMOTO, O. K.. Ultrastructural characterization of CD133(+) stem cells bound to superparamagnetic nanoparticles: possible biotechnological applications. JOURNAL OF MICROSCOPY, v. 231, n. 3, p. 374-383, . (02/01826-5)
OKAMOTO, OSWALDO KEITH; CARVALHO, ANA CAROLINA S. R.; MARTI, LUCIANA C.; VENCIO, RICARDO Z.; MOREIRA-FILHO, CARLOS A.. Common molecular pathways involved in human CD133+/CD34+progenitor cell expansion and cancer. CANCER CELL INTERNATIONAL, v. 7, . (02/01826-5)
OKAMOTO, OSWALDO K.; OBA-SHINJO, SUELI M.; LOPES, LUCIANA; MARIE, SUELY K. NAGAHASHI. Expression of HOXC9 and E2F2 are up-regulated in CD133+ cells isolated from human astrocytomas and associate with transformation of human astrocytes. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) : Gene Structure and Expression, v. 1769, n. 7/8, p. 437-442, . (02/01826-5, 01/12898-4)
MARTI, LUCIANA CAVALHEIRO; TOBO, PATRICIA RENOVATO; SOUZA RAMOS DE CARVALHO, ANA CAROLINA; DO CARMO, ALIPIO OLIVEIRA; OKAMOTO, OSWALDO KEITH; MOREIRA-FILHO, CARLOS ALBERTO. Vascular endothelial growth factor inhibits dendritic cell maturation. Einstein (São Paulo), v. 3, n. 1, p. 5-pg., . (02/01826-5)