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Caracterização funcional de uma nova proteína de Saccharomyces cerevisiae potencialmente envolvida em processamento de RNA

Processo: 05/56493-9
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2006
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Carla Columbano de Oliveira
Beneficiário:Carla Columbano de Oliveira
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Saccharomyces cerevisiae  Processamento de RNA  Expressão gênica  Genes de RNAr 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biogenese De Ribossomos | Controle De Expressao Genica | Interacao Proteina Proteina | Interacao Proteina Rna | Processamento De Rna | Saccharomyces Cerevisiae

Resumo

Da biogênese de ribossomos participam os rRNAs, proteínas ribossomais, snoRNAs e vários outros fatores (em um número estimado em 150 proteínas em levedura). Em nosso laboratório, realizamos várias seleções com o sistema do duplo-híbrido para identificar proteínas envolvidas em diferentes etapas do processamento de rRNA. Esses estudos nos levaram à identificação de novas proteínas de Saccharomyces cerevisiae e à caracterização de suas funções. Nopl7p interage com a subunidade do exossomo Rrp43p (Oliveira et al., 2002) e participa das etapas iniciais de processamento de rRNA de metilação de riboses em sítios específicos nos rRNAs (Gonzales et al., 2005). Nop53p interage com Nopl7p e está envolvida nas etapas mais tardias de processamento de rRNA, possivelmente regulando a função do exossomo (Granato el al., 2005).Este trabalho visa à continuação desses estudos, mais especificamente, a caracterização de uma proteína de S. cerevisiae que interage com Nop17p, Lr323p. Lr323p é uma proteína essencial em levedura, mas não teve ainda sua função identificada (AU)

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Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DA SILVEIRA, VIVIAN CHAGAS; BENEZRA, HENRI; LUZ, JULIANA SILVA; GEORG, RAPHAELA CASTRO; OLIVEIRA, CARLA COLUMBANO; DA COSTA FERREIRA, ANA MARIA. Binding of oxindole-Schiff base copper(II) complexes to DNA and its modulation by the ligand. Journal of Inorganic Biochemistry, v. 105, n. 12, p. 12-pg., . (05/56493-9, 05/60596-8)
DA SILVEIRA, VIVIAN CHAGAS; BENEZRA, HENRI; LUZ, JULIANA SILVA; GEORG, RAPHAELA CASTRO; OLIVEIRA, CARLA COLUMBANO; DA COSTA FERREIRA, ANA MARIA. Binding of oxindole-Schiff base copper(II) complexes to DNA and its modulation by the ligand. Journal of Inorganic Biochemistry, v. 105, n. 12, SI, p. 1692-1703, . (05/56493-9, 05/60596-8)
LUZ, JULIANA S.; GEORG, RAPHAELA C.; GOMES, CARLOS H.; MACHADO-SANTELLI, GLAUCI M.; OLIVEIRA, CARLA C.. Sdo1p, the yeast orthologue of Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein, binds RNA and interacts with nuclear rRNA-processing factors. YEAST, v. 26, n. 5, p. 287-298, . (05/56493-9)
LUZ, JULIANA S.; RAMOS, CELSO R. R.; SANTOS, MARCIA C. T.; COLTRI, PATRICIA P.; PALHANO, FERNANDO L.; FOGUEL, DEBORA; ZANCHIN, NILSON I. T.; OLIVEIRA, CARLA C.. Identification of archaeal proteins that affect the exosome function in vitro. BMC BIOCHEMISTRY, v. 11, . (05/56493-9, 07/57096-9)
GRANATO‚ D.C.; MACHADO-SANTELLI‚ G.M.; OLIVEIRA‚ C.C.. Nop53p interacts with 5.8 S rRNA co-transcriptionally‚ and regulates processing of pre-rRNA by the exosome. FEBS Journal, v. 275, n. 16, p. 4164-4178, . (05/56493-9, 03/06031-3)