Busca avançada
Ano de início
Entree

A regulacao do elemento transponivel helena em drosophila.

Processo: 07/50641-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de junho de 2007
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2010
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Claudia Marcia Aparecida Carareto
Beneficiário:Adriana Granzotto
Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Retroelementos   Elementos de DNA transponíveis   Evolução molecular   Drosophila
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Drosophila | Elementos Transponiveis | Evolucao Molecular | Helena | Retrotransposons

Resumo

Um dos grandes desafios da genética molecular de populações atual é compreender, em tempo real, a dinâmica de um genoma. O elemento Helena propicia uma oportunidade única para compreender a dinâmica de aquisição e perda de elementos num genoma, já que em D. melanogaster há uma provável inativação desse retroposon e em D. simulans, uma atividade potencial do elemento. Para compreender o processo dinâmico de aquisição e perda de Helena nos genomas, este trabalho tem os objetivos de analisar a ocorrência do elemento Helena, por Bionformática, no genoma de espécies (D. yakuba, D. erecta, D. ananassae, D. persimilis, D. pseudoobscura, D. mojavensis, D. grimshawi, D. willistoni), descrever o número de cópias de Helena, a sua localização no genoma e a sua estrutura em populações naturais de D. simulans, populações do subgrupo melanogaster, e de D. virilis por meio de Southern blot e PCR para seqüenciamento; analisar a expressão do elemento nas populações e espécies nas quais se encontram cópias completas, por meio de RT-PCR e Northern blot e testar a atividade da cópia completa de Helena a partir de construções com a região de regulação. Com este tipo de análise comparativa poderemos compreender como o elemento Helena, em particular, e os elementos transponíveis em geral, são adquiridos e perdidos pelas espécies e qual é o seu papel no processo de evolução dos genomas. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Mais itensMenos itens
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GRANZOTTO, ADRIANA; LOPES, FABRICIO R.; LERAT, EMMANUELLE; VIEIRA, CRISTINA; CARARETO, CLAUDIA M. A.. The evolutionary dynamics of the Helena retrotransposon revealed by sequenced Drosophila genomes. BMC Evolutionary Biology, v. 9, . (07/53097-0, 07/50641-1)
GRANZOTTO, ADRIANA; LOPES, FABRICIO R.; VIEIRA, CRISTINA; CARARETO, CLAUDIA M. A.. Vertical inheritance and bursts of transposition have shaped the evolution of the BS non-LTR retrotransposon in Drosophila. Molecular Genetics and Genomics, v. 286, n. 1, p. 57-66, . (07/53097-0, 07/50641-1)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
GRANZOTTO, Adriana. A regulação do elemento transponível Helena em Drosophila. 2011. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas. São José do Rio Preto São José do Rio Preto.