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Duas classes importantes de glicosil hidrolases: estudos funcionais e análise estrutural

Processo: 11/20505-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de março de 2012
Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2015
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Igor Polikarpov
Beneficiário:Marco Antonio Seiki Kadowaki
Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/56255-9 - Structure and function of enzymes and auxiliary proteins from Trichoderma, active in cell-wall hydrolysis, AP.BIOEN.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):14/15887-3 - Construção e otimização de um sistema de secreção fúngico adequado para a produção com alto rendimento de enzimas hidrolíticas e oxidativas para estudos estruturais e funcionais, BE.EP.PD
Assunto(s):Degradação de biomassa   Celulase
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Celulases | degradação de biomassa | Estudos estruturais | glicosil hidrolases | Cristalografia de proteínas

Resumo

A degradação da biomassa vegetal para a produção de etanol tem se apresentado como uma alternativa aos combustíveis fósseis e uma forma de se alcançar a independência energética. Este material rico em celulose consiste em uma fonte renovável e inesgotável cujos produtos de degradação (açúcares) podem ser utilizados para a obtenção de etanol, comumente chamado de segunda geração, através de processos fermentativos. Contudo a recalcitrância da celulose cristalina à degradação enzimática consiste em um empecilho à popularização deste produto e um dos principais desafios biotecnológicos do século 21. Desta forma o principal desafio científico neste campo consiste em desenvolver novos catalisadores ou enzimas para ampliar a produção de etanol a partir desta fonte vegetal. Este processo baseia-se na identificação, caracterização e melhoramento das enzimas responsáveis pela degradação da celulose não só de forma individual, mas também visando o desenvolvimento de coquetéis enzimáticos. Estas enzimas, chamadas genericamente de celulases, hidrolisam especificamente ligações glicosídicas do tipo ²-1-4, internamente (endoglucanases) ou através das extremidades das cadeias de celulose (exoglucanases). O melhoramento da atividade destas enzimas através de metodologias de engenharia de proteínas consiste em uma forma racional de se chegar à degradação total desta matéria prima insolúvel. Com este projeto pretende-se estudar as endoglucanases da família GHF45 e as enzimas da família GHF61 relatadas recentemente como fatores de potencialização da ação de celulases. Por meio de informações estruturais será possível compreender os mecanismos enzimáticos que servirão de base para a obtenção de proteínas com melhor desempenho. (AU)

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Publicações científicas (19)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GODOY, ANDRE SCHUTZER; CAMILO, CESAR MOISES; KADOWAKI, MARCO ANTONIO; MUNIZ, HELOISA DOS S.; SANTO, MELISSA ESPIRITO; MURAKAMI, MARIO TYAGO; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; POLIKARPOV, IGOR. Crystal structure of beta 1 -> 6-galactosidase from Bifidobacterium bifidum S17: trimeric architecture, molecular determinants of the enzymatic activity and its inhibition by alpha-galactose. FEBS Journal, v. 283, n. 22, p. 4097-4112, . (09/52840-7, 11/20505-4, 08/56255-9, 09/05328-9, 14/06565-2, 11/05712-3)
CALIFANO, DAVIDE; KADOWAKI, MARCO A. S.; CALABRESE, VINCENZO; PRADE, ROLF ALEXANDER; MATTIA, DAVIDE; EDLER, KAREN J.; POLIKARPOV, IGOR; SCOTT, JANET L.. Multienzyme Cellulose Films as Sustainable and Self-Degradable Hydrogen Peroxide-Producing Material. Biomacromolecules, v. 21, n. 12, p. 5315-5322, . (11/20505-4)
SEIKI KADOWAKI, MARCO ANTONIO; DE GODOY, MARIANA ORTIZ; KUMAGAI, PATRICIA SUEMY; DA COSTA-FILHO, ANTONIO JOSE; MORT, ANDREW; PRADE, ROLF ALEXANDER; POLIKARPOV, IGOR. Characterization of a New Glyoxal Oxidase from the Thermophilic Fungus Myceliophthora thermophila M77: Hydrogen Peroxide Production Retained in 5-Hydroxymethylfurfural Oxidation. CATALYSTS, v. 8, n. 10, . (15/13684-0, 11/20505-4)
PUHL, ANA C.; PRATES, ERICA T.; ROSSETO, FLAVIO R.; MANZINE, LIVIA R.; STANKOVIC, IVANA; DE ARAUJO, SIMARA S.; ALVAREZ, THABATA M.; SQUINA, FABIO M.; SKAF, MUNIR S.; POLIKARPOV, IGOR. Crystallographic structure and molecular dynamics simulations of the major endoglucanase from Xanthomonas campestris pv. campestris shed light on its oligosaccharide products release pattern. International Journal of Biological Macromolecules, v. 136, p. 493-502, . (11/20505-4, 15/13684-0, 09/52840-7, 10/52362-5, 11/21608-1, 15/50590-4)
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GODOY, ANDRE S.; PEREIRA, CAROLINE S.; RAMIA, MARINA PAGLIONE; SILVEIRA, RODRIGO L.; CAMILO, CESAR M.; KADOWAKI, MARCO A.; LANGE, LENE; BUSK, PETER K.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; SKAF, MUNIR S.; et al. Structure, computational and biochemical analysis of PcCel45A endoglucanase from Phanerochaete chrysosporium and catalytic mechanisms of GH45 subfamily C members. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . (15/13684-0, 11/21608-1, 10/52362-5, 11/20505-4)
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KADOWAKI, MARCO A. S.; VARNAI, ANIKO; JAMESON, JOHN-KRISTIAN; LEITE, ANA E. T.; COSTA-FILHO, ANTONIO J.; KUMAGAI, PATRICIA S.; PRADE, ROLF A.; POLIKARPOV, IGOR; EIJSINK, VINCENT G. H.. Functional characterization of a lytic polysaccharide monooxygenase from the thermophilic fungus Myceliophthora thermophila. PLoS One, v. 13, n. 8, . (11/20505-4, 15/13684-0)
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GODOY, ANDRE SCHUTZER; CAMILO, CESAR MOISES; KADOWAKI, MARCO ANTONIO; MUNIZ, HELOISA DOS S.; SANTO, MELISSA ESPIRITO; MURAKAMI, MARIO TYAGO; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; POLIKARPOV, IGOR. Crystal structure of beta 1 -> 6-galactosidase from Bifidobacterium bifidum S17: trimeric architecture, molecular determinants of the enzymatic activity and its inhibition by alpha-galactose. FEBS Journal, v. 283, n. 22, p. 16-pg., . (11/05712-3, 09/52840-7, 11/20505-4, 14/06565-2, 08/56255-9, 09/05328-9)
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SEIKI KADOWAKI, MARCO ANTONIO; RABELO HIGASI, PAULA MIWA; DE GODOY, MARIANA ORTIZ; DE ARAUJO, EVANDRO ARES; GODOY, ANDRE SCHUTZER; PRADE, ROLF ALEXANDER; POLIKARPOV, IGOR. Enzymatic versatility and thermostability of a new aryl-alcohol oxidase from Thermothelomyces thermophilus M77. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1864, n. 10, . (15/13684-0, 11/20505-4)
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