Busca avançada
Ano de início
Entree

Detecção e consequências de desequilíbrios no genoma humano

Processo: 18/08890-9
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2018
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Társis Antônio Paiva Vieira
Beneficiário:Társis Antônio Paiva Vieira
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Vera Lúcia Gil da Silva Lopes
Assunto(s):Genoma humano  Variação estrutural do genoma  Sequenciamento completo do exoma  Mutação  Fenótipo  Predisposição genética para doença 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Desequilíbrios Genômicos | sequenciamento do exoma | Variantes de significado incerto | Citogenética Humana

Resumo

Os desequilíbrios genômicos (DGs) são uma forma importante de variação no genoma humano. Muitos deles estão relacionados a doenças e são a causa do fenótipo em parte significativa (10 - 20%) dos indivíduos com anomalias congênitas múltiplas (ACM) e (ou) deficiência intelectual (DI)/ atraso no desenvolvimento neuropsicomotor (ADNPM). Atualmente, a técnica de análise cromossômica por microarray (CMA) é utilizada como primeiro teste diagnóstico nesses indivíduos. Entretanto, trabalhos recentes têm sugerido que o sequenciamento do exoma (WES) poderia substituir o CMA como primeiro teste diagnóstico, com a vantagem de que este último poderia identificar tanto mutações gênicas como DGs, com os dados de um único experimento. Porém, até o momento, há poucos estudos com grupos de pacientes e ainda não há um consenso se a análise de DGs em dados de WES realmente pode substituir a CMA. Por outro lado, um desafio constante na interpretação dos DGs identificados por CMA em indivíduos com ACM e (ou) DI/ ADNPM é a identificação de variantes de significado incerto (VUS). Recentemente, sugeriu-se que o WES seria essencial para a conclusão diagnóstica nestes casos. Deste modo, os objetivos deste projeto são: realizar o sequenciamento do exoma e investigar mutações gênicas relacionadas ao fenótipo em indivíduos com ACM e (ou) ADNPM/ DI, com VUS detectadas previamente por CMA; e identificar as alterações encontradas pela técnica de CMA, através da análise de DGs em dados de exoma, neste mesmo grupo de indivíduos. Serão selecionados 50 indivíduos com ACM e (ou) DI/ ADNPM com VUS detectadas previamente por CMA. Será realizado o sequenciamento do exoma e posteriormente duas análises distintas: investigação de mutações gênicas relacionadas ao fenótipo e investigação de DGs nos dados do sequenciamento do exoma. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Mais itensMenos itens
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CORREIA-COSTA, GABRIELA ROLDAO; DOS SANTOS, ANA MONDADORI; DE LEEUW, NICOLE; RIGATTO, SUMARA ZUANAZI PINTO; BELANGERO, VERA MARIA SANTORO; STEINER, CARLOS EDUARDO; GIL-DA-SILVA-LOPES, VERA LUCIA; VIEIRA, TARSIS PAIVA. Dual Molecular Diagnoses of Recessive Disorders in a Child from Consanguineous Parents: Case Report and Literature Review. GENES, v. 13, n. 12, p. 11-pg., . (18/08890-9)
CORREIA-COSTA, G. R.; SPINELI-SILVA, S.; SGARDIOLI, I. C.; DOS-SANTOS, A. P.; MARQUES-PROTA, J. R.; SECOLIN, R.; LEIJSTEN, N.; RUITERKAMP-VERSTEEG, M. H. A.; DE LEEUW, N.; LOPES-CENDES, I.; et al. Report and investigation of regions of homozygosity in the autosomal genome of Brazilian individuals with intellectual disability and (or) multiple congenital anomalies previously investigated by chromosomal microarray analysis. European Journal of Human Genetics, v. 28, n. SUPPL 1, p. 1-pg., . (18/08890-9)
SPINELI-SILVA, S.; DE LEEUW, N.; DOS SANTOS, A. P.; LEIJSTEN, N.; RUITERKAMP-VERSTEEG, M. H. A.; PROTA, J. R. M.; MACIEL-GUERRA, A. T.; MARQUES-DE-FARIA, A.; STEINER, C. E.; GIL-DA-SILVA-LOPES, V. L.; et al. Whole Exome Sequencing in Brazilian individuals with intellectual disability, Neurodevelopmental Delay and (or) Multiple Congenital Anomalies with Copy Number Variants of Uncertain Clinical Significance detected by Chromosomal Microarray Analysis. European Journal of Human Genetics, v. 28, n. SUPPL 1, p. 1-pg., . (18/08890-9)
CORREIA-COSTA, GABRIELA ROLDAO; DE LEEUW, NICOLE; PFUNDT, ROLPH; SGARDIOLI, ILARIA CRISTINA; DOS SANTOS, ANA PAULA; SANTOS, MARILZA DE LIMA; GIL-DA-SILVA-LOPES, VERA LUCIA; VIEIRA, TARSIS PAIVA. Biallelic frameshift variant in the TBC1D2B gene in two siblings with progressive gingival overgrowth, fibrous dysplasia of face, and mental deterioration. Clinical Genetics, v. 102, n. 6, p. 6-pg., . (12/51799-6, 18/08890-9)
GABRIELA ROLDÃO CORREIA-COSTA; ILÁRIA CRISTINA SGARDIOLI; ANA PAULA DOS SANTOS; TÂNIA KAWASAKI DE ARAUJO; RODRIGO SECOLIN; ISCIA LOPES-CENDES; VERA LÚCIA GIL-DA-SILVA-LOPES; TÁRSIS PAIVA VIEIRA. Increased runs of homozygosity in the autosomal genome of Brazilian individuals with neurodevelopmental delay/intellectual disability and/or multiple congenital anomalies investigated by chromosomal microarray analysis. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 45, n. 1, . (18/08890-9, 12/51799-6)