Estudo de proteínas estruturais do material genético bacteriano

Resumo

O material genético bacteriano é organizado numa estrutura compacta e dinâmica denominada nucleoide. Parte dessa organização se deve à ação de um conjunto de proteínas que se ligam ao DNA e alteram localmente sua estrutura. Como as modificações estruturais do DNA bacteriano são diferentes daquelas proporcionadas por histonas nas células eucarióticas, a inibição de proteínas responsáveis pela organização do nucleoide representa uma promissora estratégia de controle bacteriano alternativa ao uso de antibióticos. As proteínas que organizam o material genético bacteriano, por modificarem sua estrutura, também afetam a expressão gênica global. Apesar da importância, o papel de proteínas do nucleoide na organização do DNA e na expressão gênica tem sido investigado em apenas alguns organismos modelos. Em Escherichia coli e Salmonella enterica, a proteína H-NS compacta o DNA e reprime a expressão gênica ao promover a união de segmentos adjacentes do cromossomo. A comparação entre as estruturas primárias dos membros da família H-NS sugere que essas proteínas possam diferir entre si com base em algumas propriedades. Todavia, o impacto dessas diferenças estruturais na maneira com que o DNA é organizado e a expressão gênica é afetada por H-NS nas diferentes bactérias não é conhecido. Um dos objetivos dessa proposta de pesquisa é investigar essa diversidade estrutural e funcional entre as proteínas H-NS por meio da caracterização da versão encurtada de H-NS presente na bactéria Bartonella henselae. Também pretendemos expandir o repertório de potenciais alvos do controle bacteriano ao estudar proteínas do nucleoide de Burkholderia cenocepacia. Por fim, um estudo visando a identificação de peptídeos sintéticos com função inibidora de uma proteína do nucleoide de B. cenocepacia também faz parte dessa proposta. (AU)