Panorama geral do transcriptoma das proteínas de membrana celular humana ao longo dos estágios de neurodesenvolvimento de modelos de organóides cerebrais

Resumo

O cérebro é único em termos evolutivos, permitindo que os humanos realizem tarefas complexas, tais como pensamento e formação de memória. Da mesma forma, é igualmente notória a dificuldade observada por muitos anos no estudo desse órgão. Felizmente, uma recente e poderosa ferramenta celular, os organóides cerebrais ("minicérebros"), impulsionaram a forma como investigamos o desenvolvimento do cérebro e distúrbios neuronais, como o Autismo. No entanto, pouco se sabe sobre o perfil de expressão gênica e outros eventos pós-transcricionais, como o splicing alternativo (AS), no desenvolvimento de organóides cerebrais em vários momentos. Ao mesmo tempo, várias tecnologias "OMICs", como o sequenciamento de RNA (RNA-seq), têm sido cada vez mais aplicadas na pesquisa translacional para elucidar a transcriptômica de genes com potencial terapêutico (por exemplo, EGFR em gliomas). As proteínas de membrana celular ("surfaceoma") são de particular interesse clínico devido à sua região celular mais acessível a drogas e à sua participação na regulação de diversos processos. Como resultado, conhecer seus perfis de expressão gênica e isoformas alternativas durante os estágios de neurodesenvolvimento dos organóides cerebrais pode ser a chave para aprimorar o uso dessa ferramenta na medicina de precisão. Neste projeto, pretendemos investigar de maneira global o panorama transcriptômico do surfaceoma de modelos de organóides cerebrais humanos normais ao longo de seus estágios de neurodesenvolvimento, tanto com "bulk" quanto com RNA-seq de células únicas. No final, buscamos descobrir em organóides cerebrais um conjunto de genes do "surfaceoma" e isoformas de splicing distintas do desenvolvimento do cérebro e potenciais novos biomarcadores a serem explorados na clínica em um contexto mais amplo, incluindo distúrbios neuronais e câncer. (AU)