| Texto completo | |
| Autor(es): |
de Souza, Marcela M.
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Zerlotini, Adhemar
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Geistlinger, Ludwig
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Tizioto, Polyana C.
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Taylor, Jeremy F.
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Rocha, Marina I. P.
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Diniz, Wellison J. S.
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Coutinho, Luiz L.
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Regitano, Luciana C. A.
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Número total de Autores: 9
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| Afiliação do(s) autor(es): | [1] Embrapa Pecuaria Sudeste, Anim Biotechnol, BR-13560970 Sao Carlos, SP - Brazil
[2] Univ Fed Sao Carlos, Postgrad Program Evolutionary Genet & Mol Biol, BR-13560970 Sao Carlos, SP - Brazil
[3] Embrapa Informat Agropecuaria, Bioinformat Multiuser Lab, BR-70770901 Campinas, SP - Brazil
[4] NGS Genom Solut, Piracicaba, SP - Brazil
[5] Univ Missouri, Dept Anim Sci, Columbia, MO 65211 - USA
[6] Univ Sao Paulo, Funct Genom Ctr, BR-13418900 Piracicaba, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 6
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | SCIENTIFIC REPORTS; v. 8, SEP 13 2018. |
| Citações Web of Science: | 2 |
| Resumo | |
Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a context-dependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an improved comprehension of regulatory mechanisms that are specific to the species. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 12/23638-8 - Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore |
| Beneficiário: | Luciana Correia de Almeida Regitano |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Temático |
| Processo FAPESP: | 12/20328-8 - Avaliação da expressão alélica em genes associados à maciez de carne em animais Nelore por meio de análise transcriptômica. |
| Beneficiário: | Marcela Maria de Souza |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Processo FAPESP: | 14/15183-6 - Identificação e caracterização do repertório de fatores de transcrição de bovinos |
| Beneficiário: | Marcela Maria de Souza |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |