Protocolo otimizado para isolar DNA genômico de alta qualidade em diferentes tecidos de uma espécie de palmeira

Autor(es)

Marília Souza Lucas ^[1] ; Carolina da Silva Carvalho ; Giovane Böerner Hypolito ^[3] ; Marina Corrêa Côrtes ^[4]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Universidade do Estado de São Paulo. Instituto de Biociências. Departamento de Ecologia - Brasil

^[3] Universidade do Estado de São Paulo. Instituto de Biociências. Departamento de Ecologia - Brasil

^[4] Universidade do Estado de São Paulo. Instituto de Biociências. Departamento de Ecologia - Brasil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Hoehnea; v. 46, n. 2 2019-07-22.

Resumo

RESUMO A aplicação de técnicas moleculares para lidar com questões ecológicas e evolutivas requer DNA genômico de boa qualidade e quantidade. A qualidade do DNA isolado, no entanto, pode ser influenciada pelo tipo de tecido e pela maneira como a amostra foi conservada e manipulada. Portanto, personalizar protocolos para melhorar o isolamento do DNA e a amplificação dos locus é crucial. Nós otimizamos um protocolo barato e manual de extração de DNA e amplificação de microssatélites utilizando cinco diferentes tecidos de uma espécie de palmeira da Mata Atlântica brasileira. Nós extraímos com sucesso o DNA de todos os cinco tipos de tecidos. Folha, caule e endocarpo de sementes não dispersas apresentaram as maiores taxas de extração de DNA e amplificação de microssatélites; enquanto raiz, endocarpo de sementes dispersas e embrião apresentaram a menor qualidade e quantidade. Com base nesses resultados, discutimos as implicações do uso de diferentes tecidos para estudos sobre dispersão de sementes, polinização e genética de populações. (AU)

• Processo FAPESP: 14/01029-5 - Efeitos ecológicos e genéticos da variação do tamanho das sementes em paisagem defaunada
• Beneficiário: Carolina da Silva Carvalho
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 16/18235-2 - Dispersão de pólen e sistema reprodutivo da palmeira Euterpe edulis em fragmentos da Mata Atlântica
• Beneficiário: Giovane Böerner Hypolito
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica