Improvement of Targeted Fungi Secondary Metabolite Production Using a Systematic Experimental Design and Chemometrics Analysis

Autor(es)

Michaliski, Lamonielli F. ; Ioca, Laura P. ; Oliveira, Leandro S. ; Crnkovic, Camila M. ; Takaki, Mirelle ; Freire, Vitor F. ; Berlinck, Roberto G. S.

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: METHODS AND PROTOCOLS; v. 6, n. 5, p. 18-pg., 2023-10-01.

Resumo

Fungi are well-known producers of chemically diverse and biologically active secondary metabolites. However, their production yields through fermentation may hamper structural analysis and biological activity downstream investigations. Herein, a systematic experimental design that varies multiple cultivation parameters, followed by chemometrics analysis on HPLC-UV-MS or UHPLC-HRMS/MS data, is presented to enhance the production yield of fungal natural products. The overall procedure typically requires 3-4 months of work when first developed, and up to 3 months as a routine procedure. (AU)

• Processo FAPESP: 19/07894-3 - Descoberta de metabólitos secundários bioativos produzidos por linhagens microbianas de ambientes isolados e estudo de biossíntese de alpha-aminopironas produzidas por Aspergillus sp. DLM38
• Beneficiário: Lamonielli Fagá Michaliski
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 15/01017-0 - EMU concedido no âmbito do projeto aprovado 2013/50228-8, nome do equipamento: uPLC-HRMS (cromatógrafo líquido de ultra resolução acoplado com espectrômetro de massas de alta resolução)
• Beneficiário: Roberto Gomes de Souza Berlinck
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 22/07831-4 - Biossíntese de fomactinas produzidas pelo fungo Biatriospora sp. CBMAI 1333 e alfa-aminopironas produzidas pelo fungo Aspergillus sp. DLM38
• Beneficiário: Lamonielli Fagá Michaliski
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 16/05133-7 - Estudo do metabolismo de micro-organismos do ambiente marinho: perfil químico e biossíntese
• Beneficiário: Laura Pavan Ióca
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 15/14114-3 - Quais componentes metabolômicos influenciam a fitopatogenicidade de Colletotrichum spp.?
• Beneficiário: Mirelle Takaki
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 19/17721-9 - A função da Química na adaptação de holobiontes
• Beneficiário: Roberto Gomes de Souza Berlinck
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 18/10742-8 - A função de um peptídeo não-ribossimal para promover a motilidade de Pseudovibrio brasiliensis Ab134 e bactérias relacionadas
• Beneficiário: Laura Pavan Ióca
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Processo FAPESP: 18/03679-8 - Emprego de ferramentas estatísticas e redes moleculares para análises metabolômicas de Colletotrichum spp.
• Beneficiário: Mirelle Takaki
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Processo FAPESP: 19/00447-1 - Aumento e diversificação da produção e estudos de biossíntese de fomactinas produzidas pelo fungo Biatriospora sp. CBMAI 1333
• Beneficiário: Camila Manoel Crnkovic
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado