ISER: selection of differentially expressed genes from DNA array data by non-linear data transformations and local fitting

Autor(es)

Drummond, R. D. ; Pinheiro, A. ; Rocha, C. S. ; Menossi, M. ^[4]

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Bioinformatics; v. 21, n. 24, p. 4427-4429, Dec. 2005.
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Assunto(s): Genômica Expressão gênica

Resumo

This report describes an algorithm (intensity-dependent selection of expression ratios or ISER) developed to analyse DNA array data by optimizing the selection of genes with the most significant variations in expression amongst two RNA samples. The algorithm is designed for use when little or no replication of array hybridizations is available. (AU)

• Processo FAPESP: 03/07244-0 - Transcriptoma da cana-de-açúcar
• Beneficiário: Glaucia Mendes Souza
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Parceria para Inovação Tecnológica - PITE
• Processo FAPESP: 02/01167-1 - Desenvolvimento de marcadores moleculares a partir de ESTs de cana-de-acúcar para seleção de características economicamente importantes
• Beneficiário: Anete Pereira de Souza
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Parceria para Inovação Tecnológica - PITE