Small-angle X-ray scattering and structural modeling of full-length: cellobiohydrolase I from Trichoderma harzianum

Autor(es)

Lima, Leonardo H. F. ^[1] ; Serpa, Viviane I. ^[1] ; Rosseto, Flavio R. ^[1] ; Sartori, Geraldo Rodrigues ^[1] ; de Oliveira Neto, Mario ^[1] ; Martinez, Leandro ^[1] ; Polikarpov, Igor ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Grp Biotecnol Mol, IFSC, BR-13566570 Sao Carlos, SP - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Cellulose; v. 20, n. 4, p. 1573-1585, AUG 2013.
• Citações Web of Science: 7

Resumo

Cellobiohydrolases hydrolyze cellulose releasing cellobiose units. They are very important for a number of biotechnological applications, such as, for example, production of cellulosic ethanol and cotton fiber processing. The Trichoderma cellobiohydrolase I (CBH1 or Cel7A) is an industrially important exocellulase. It exhibits a typical two domain architecture, with a small C-terminal cellulose-binding domain and a large N-terminal catalytic core domain, connected by an O-glycosylated linker peptide. The mechanism by which the linker mediates the concerted action of the two domains remains a conundrum. Here, we probe the protein shape and domain organization of the CBH1 of Trichoderma harzianum (ThCel7A) by small angle X-ray scattering (SAXS) and structural modeling. Our SAXS data shows that ThCel7A linker is partially-extended in solution. Structural modeling suggests that this linker conformation is stabilized by inter- and intra-molecular interactions involving the linker peptide and its O-glycosylations. (AU)

• Processo FAPESP: 08/56255-9 - Structure and function of enzymes and auxiliary proteins from Trichoderma, active in cell-wall hydrolysis
• Beneficiário: Igor Polikarpov
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Temático
• Processo FAPESP: 07/08706-9 - Estudos moleculares e estruturais de enzimas do complexo celulolítico do fungo Trichoderma harzianum com potencial na transformação enzimática da biomassa
• Beneficiário: Viviane Isabel Serpa
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 10/16947-9 - Estrutura, dinâmica e função em proteínas: simulação computacional e desenvolvimento de algoritmos
• Beneficiário: Leandro Martinez
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 09/52840-7 - Centro de Processos Biológicos e Industriais para Biocombustíveis - CeProBIO
• Beneficiário: Igor Polikarpov
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Temático
• Processo FAPESP: 08/05637-9 - Estudos dos três isotipos do receptor ativador de proliferação de peroxissomos (hPPAR) e da interação destes com receptor de retinoides X hRXRalfa em solução usando espalhamento de raios-X a baixo ângulo
• Beneficiário: Mario de Oliveira Neto
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado