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Mapeamento genético e identificação de marcadores moleculares genômicos e funcionais associados a características agronômicas de interesse em cana-de-açúcar

Processo:05/55258-6
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2005
Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2009
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:Luciana Rossini Pinto Machado da Silva
Beneficiário:Luciana Rossini Pinto Machado da Silva
Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Campinas , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:Campinas
Bolsa(s) vinculada(s):09/51121-7 - Avaliação de marcadores do tipo AFLP (Amplified Fragment Lenght Polymorphism) em uma população de mapeamento de cana-de-açúcar, BP.IC
07/57828-0 - Identificacao de marcadores microssatelites genomicos e funcionais associados a parametros agroindustriais em cana de acucar., BP.MS
07/54631-0 - Análise de ligação entre marcadores moleculares do tipo microssatélites funcionais em uma população segregante de cana-de-açúcar, BP.IC
06/61144-6 - Mapeamento genetico e identificacao de marcadores moleculares genomicos e funcionais associados a caracteristicas agronomicas de interesse em cana de acucar., BP.TT
Assunto(s):Mapeamento genético  Marcador molecular  Cana-de-açúcar 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cana De Acucar | Ests | Ferrugem | Mapeamento Genetico | Marcadores Moleculares | Qtls
Publicação FAPESP:https://media.fapesp.br/bv/uploads/pdfs/Investindo...pesquisadores_4_51_52.pdf

Resumo

No Brasil, o agronegócio da cana-de-açúcar movimenta cerca de 36 bilhões de reais por ano. O mapeamento de QTLs referentes ao teor de açúcar e os componentes de produção (número de perfilhos, diâmetro e altura de colmos) é de grande importância para o melhoramento da cana-de-açúcar. O Sucest viabilizou o desenvolvimento de marcadores funcionais para o mapeamento genético. Tais marcadores são ideais para seleção assistida, visto que os mesmos podem ser os responsáveis pela característica em questão. O presente projeto visa iniciar um programa de mapeamento genético para o programa Cana IAC. Marcadores moleculares do tipo AFLP, microssatélites genômicos e funcionais (ESTSSRs) com homologia a genes de interesse serão utilizados para a construção de um mapa genético a partir de um cruzamento bi-parental, entre materiais elites do programa. Pretende-se detectar e mapear QTLs associados ao teor de açúcar e aos componentes de produção e verificar a associação de marcadores RFLPs-PCRs desenvolvidos a partir de ESTs correspondentes a genes expressos durante a interação com Puccinia melanocephala, com a resistência a ferrugem. A construção deste mapa genético auxiliará na validação de marcadores genômicos e funcionais associados a características agronômicas de interesse identificados em outros mapas de cana-de-açúcar, dando suporte na aplicação destes marcadores para seleção assistida. (AU)

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Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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DOS SANTOS, FERNANDA R. C.; ZUCCHI, MARIA I.; PARK, JONG-WON; BENATTI, THIAGO R.; DA SILVA, JORGE A.; SOUZA, GLAUCIA M.; LANDELL, MARCOS G. A.; PINTO, LUCIANA R.. New Sugarcane Microsatellites and Target Region Amplification Polymorphism Primers Designed from Candidate Genes Related to Disease Resistance. SUGAR TECH, v. 19, n. 2, p. 219-224, . (05/55258-6, 08/52146-0)
AONO, ALEXANDRE HILD; GONZAGA PIMENTA, RICARDO JOSE; BASSO GARCIA, ANA LETYCIA; CORRER, FERNANDO HENRIQUE; HOSAKA, GUILHERME KENICHI; CARRASCO, MARISHANI MARIN; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; MANCINI, MELINA CRISTINA; SFORCA, DANILO AUGUSTO; DOS SANTOS, LUCAS BORGES; et al. The Wild Sugarcane and Sorghum Kinomes: Insights Into Expansion, Diversification, and Expression Patterns. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, . (14/11482-9, 18/18588-8, 19/03232-6, 10/50091-4, 15/22993-7, 10/50119-6, 15/16399-5, 08/52197-4, 19/21682-9, 05/55258-6, 20/07434-0, 19/19340-2)
AONO, ALEXANDRE HILD; COSTA, ESTELA ARAUJO; SILVA RODY, HUGO VIANNA; NAGAI, JAMES SHINITI; GONZAGA PIMENTA, RICARDO JOSE; MANCINI, MELINA CRISTINA; CAMILO DOS SANTOS, FERNANDA RAQUEL; PINTO, LUCIANA ROSSINI; DE ANDRADE LANDELL, MARCOS GUIMARAES; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; et al. Machine learning approaches reveal genomic regions associated with sugarcane brown rust resistance. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, . (10/50031-1, 18/18588-8, 05/55258-6, 14/11482-9, 08/52197-4, 19/03232-6)
SANTOS, FERNANDA R. C.; PINTO, LUCIANA R.; CARLINI-GARCIA, LUCIANA A.; GAZAFFI, RODRIGO; MANCINI, MELINA C.; GONCALVES, BRUNA S.; MEDEIROS, CIBELE N. F.; PERECIN, DILERMANDO; GARCIA, ANTONIO A. F.; SOUZA, ANETE P.; et al. Marker-trait association and epistasis for brown rust resistance in sugarcane. EUPHYTICA, v. 203, n. 3, p. 533-547, . (05/55258-6, 09/51121-7, 09/51392-0, 07/54631-0)
MANCINI, M. C.; LEITE, D. C.; PERECIN, D.; BIDOIA, M. A. P.; XAVIER, M. A.; LANDELL, M. G. A.; PINTO, L. R.. Characterization of the Genetic Variability of a Sugarcane Commercial Cross Through Yield Components and Quality Parameters. SUGAR TECH, v. 14, n. 2, p. 119-125, . (05/55258-6, 07/57828-0)
PINTO, L. R.; LEITE, D. C.; FAVERO, T. M.; PASTINA, M. M.; GARCIA, A. A. F.; PERECIN, D.; GONCALVES, B. S.; CRESTE, S.; XAVIER, M. A.; BIDOIA, M. A. P.; et al. Identification of microsatellites markers associated with yield components and quality parameters in sugarcane. INTERNATIONAL SUGAR JOURNAL, v. 113, n. 1346, p. 140-144, . (05/55258-6, 07/54631-0, 07/57828-0)