Transcriptômica para identificação de genes de interesse comercial em cana-de-açúcar

Resumo

Apesar da grande importância econômica da cana-de-açúcar, conhecimentos a respeito da regulação da expressão gênica envolvida no controle dos diversos processos biológicos de interesse comercial nessa espécie são exíguos. Entre estes, destaca-se a produção diferencial de açúcar e de biomassa entre genótipos diversos, além do comportamento dos mesmos frente a estresses abióticos como o déficit hídrico. O objetivo do presente projeto de pesquisa é estudar os perfis de expressão gênica de genótipos de cana-de-açúcar, escolhidos com base em diferenças nos valores desses caracteres fenotípicos, a fim de identificar genes diferencialmente expressos responsáveis pela expressão dos fenótipos. Adicionalmente, será estudada a relação entre a dosagem alélica de variantes do tipo SNP e o nível relativo de expressão dos vários alelos de cada transcrito, de modo a identificar expressão diferencial de alelos. Serão coletadas amostras de folhas, colmos e raízes de vários genótipos distintos, situados em extremos das distribuições fenotípicas dos caracteres de interesse. A metodologia de sequenciamento de RNA mensageiro será utilizada para quantificar os níveis de expressão dos transcritos de cada amostra, em escala genômica. Análises de expressão diferencial de genes serão aplicadas entre grupos de genótipos contrastantes quanto ao acúmulo de açúcar, produção de biomassa e resistência à seca. Espera-se identificar genes responsáveis pela performance diferencial dos genótipos superiores, o que contribuirá para a elucidação dos mecanismos moleculares envolvidos no controle desses caracteres. Estas informações serão cruciais para o delineamento de programas de melhoramento molecular da cana-de-açúcar, importantes para que o setor bioenergético seja capaz de suprir demandas atuais e futuras. (AU)