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Avaliação da sintenia genômica entre sorgo (Sorghum bicolor) e cana-de-açúcar (Saccharum officinarum): comparação dos genes envolvidos em um QTL para Brix em sorgo à região sintênica em cana-de-açúcar

Processo: 14/11482-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2014
Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2018
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Melina Cristina Mancini
Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):17/05014-0 - Análise de genes envolvidos em um QTL para brix em espécies Saccarum, BE.EP.PD
Assunto(s):Mapeamento genético   Marcador molecular
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Autopoliploide | BAC (Bacterial Artificial Chromosome) | Genoma complexo | Mapeamento comparativo | Mapeamento genético | marcador molecular | Melhoramento Genético de Plantas

Resumo

A cana-de-açúcar é uma espécie poliploide e aneuploide, o que torna sua investigação genética e genômica um grande desafio. Seu cultivo situa o Brasil como o maior produtor mundial, seguido por Índia e China. Atualmente destaca-se entre uma das culturas de maior importância econômica, fato atribuído à seus derivados, açúcar e etanol, alavancando grandes investimentos financeiros e científico na pesquisa. Tendo em vista os avanços alcançados em um estudo mais aprofundado de uma região específica de seu genoma, o presente projeto parte da premissa da existência de alta sintenia entre sorgo e cana para detectar genes presentes em um QTL (quantitative trait loci) para Brix (quantidade de sólidos solúveis). Utilizando os BACs (bacterial artificial chromosome) como uma ferramenta molecular a fim de tornar a cana um organismo "haplóide", isto é, onde cada alelo possa ser estudado individualmente, informações genéticas e moleculares originadas do sorgo poderão ser transferidas e aplicadas para o genoma da cana-de-açúcar, trazendo significantes implicações práticas no melhoramento da espécie. (AU)

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Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MANCINI, MELINA C.; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO B.; SFORCA, DANILO A.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. ``Targeted Sequencing by Gene Synteny,{''} a New Strategy for Polyploid Species: Sequencing and Physical Structure of a Complex Sugarcane Region. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 9, . (17/05014-0, 10/50119-6, 15/16399-5, 14/11482-9, 08/52197-4)
SFORCA, DANILO AUGUSTO; VAUTRIN, SONIA; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; MANCINI, MELINA CRISTINA; ROMERO-DA CRUZ, MARIA VICTORIA; PEREIRA, GUILHERME DA SILVA; CONTE, MONICA; BELLEC, ARNAUD; DAHMER, NAIR; FOURMENT, JOELLE; et al. Gene Duplication in the Sugarcane Genome: A Case Study of Allele Interactions and Evolutionary Patterns in Two Genic Regions. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 10, . (15/16399-5, 08/52197-4, 10/50119-6, 14/11482-9)
AONO, ALEXANDRE HILD; GONZAGA PIMENTA, RICARDO JOSE; BASSO GARCIA, ANA LETYCIA; CORRER, FERNANDO HENRIQUE; HOSAKA, GUILHERME KENICHI; CARRASCO, MARISHANI MARIN; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; MANCINI, MELINA CRISTINA; SFORCA, DANILO AUGUSTO; DOS SANTOS, LUCAS BORGES; et al. The Wild Sugarcane and Sorghum Kinomes: Insights Into Expansion, Diversification, and Expression Patterns. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, . (14/11482-9, 18/18588-8, 19/03232-6, 10/50091-4, 15/22993-7, 10/50119-6, 15/16399-5, 08/52197-4, 19/21682-9, 05/55258-6, 20/07434-0, 19/19340-2)
AONO, ALEXANDRE HILD; COSTA, ESTELA ARAUJO; SILVA RODY, HUGO VIANNA; NAGAI, JAMES SHINITI; GONZAGA PIMENTA, RICARDO JOSE; MANCINI, MELINA CRISTINA; CAMILO DOS SANTOS, FERNANDA RAQUEL; PINTO, LUCIANA ROSSINI; DE ANDRADE LANDELL, MARCOS GUIMARAES; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; et al. Machine learning approaches reveal genomic regions associated with sugarcane brown rust resistance. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, . (10/50031-1, 18/18588-8, 05/55258-6, 14/11482-9, 08/52197-4, 19/03232-6)
CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; AONO, ALEXANDRE HILD; MANCINI, MELINA CRISTINA; SFORCA, DANILO AUGUSTO; DA SILVA, CARLA CRISTINA; PINTO, LUCIANA ROSSINI; ADAMS, KEITH L.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Taxonomically Restricted Genes Are Associated With Responses to Biotic and Abiotic Stresses in Sugarcane (Saccharum spp.). FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 13, p. 13-pg., . (14/11482-9, 15/16399-5, 19/03232-6, 15/24346-9, 17/26781-0, 08/52197-4)
MANCINI, MELINA C.; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO B.; SFORCA, DANILO A.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. "Targeted Sequencing by Gene Synteny," a New Strategy for Polyploid Species: Sequencing and Physical Structure of a Complex Sugarcane Region. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 9, p. 8-pg., . (17/05014-0, 14/11482-9, 15/16399-5, 10/50119-6, 08/52197-4)