Ligação cruzada in vivo: um modo mais abrangente para determinar interações entre proteínas

Resumo

Ligação cruzada acoplada a espectrometria de massas (XLMS) é uma ótima ferramenta para estudar interações proteína-proteína. Nessa metodologia, complexos proteicos são reagidos com agentes de ligação cruzada in vitro, seguido da identificação dos peptídeos ligados por espectrometria de massas. Embora essa metodologia tenha sido aplicada com sucesso para caracterização de complexos proteicos, a necessidade de trabalhar in vitro dificulta a identificação de interações transientes e de baixa afinidade. O grupo de pesquisa do Prof. James Bruce (Universidade de Washington) é pioneiro e líder na metodologia de ligação cruzada in vivo. Nessa abordagem, os complexos proteicos que são amostrados estão em sua forma nativa, já que as reações são realizadas dentro das células. Nesse projeto, o principal objetivo é aplicar essa metodologia para estudar células de câncer quimo resistentes com a finalidade de quantificar as interações proteicas, bem como as interações transientes. Essa metodologia poderá ser aplicada no futuro no projeto da Dra. Mariana no Brasil.