EMU concedido no processo 2012/50191-4: espectrômetro de massas IMPACT II da Bruker

• Processo: 18/13588-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2025
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Maria Aparecida Juliano
• Beneficiário: Maria Aparecida Juliano
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 12/50191-4 - Síntese, estudo cinético e aplicações de substratos e inibidores de enzimas proteolíticas, AP.TEM
• Assunto(s): Enzimas proteolíticas Proteômica Proteínas Espectrômetros Espectrometria de massas Equipamentos multiusuários
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: enzimas proteoliticas | peptidolítica | proteínas | proteômica | Proteínas- peptídeos
• Página web do EMU: http://www.posgrad.epm.br/multiequipa/
• Tipo de equipamento: Caracterização de Materiais - Espectrometria - De massas
• Fabricante: Bruker
• Modelo: Impact II

Resumo

Usamos espectrometria de massas desde 1994, como ferramenta de controle na síntese paralela de peptídeos estabelecidos por nós desde 1990 e esta experiência nos credenciou a usar a espectroscopia de massas no desenvolvimento de novos projetos, bem como na complementação nos vigentes. A três anos a UNIFESP vem estruturando a área de oncologia, agregando pesquisadores de diferentes áreas e de diferentes instituições do Estado de São Paulo, com quem já tínhamos colaborações devido aos peptídeos e agora estamos em condições de contribuir com a espectrometria de massas. Atualmente estamos envolvidos em colaborações com o Dr. André Vettore e a Dra. Giselle Zanker, professores da UNIFESP- Campus Diadema na identificação das classes das proteases de células tumorais de cabeça e pescoço, cérebro e células leucêmicas usando substratos e inibidores. A próxima etapa será a identificação das proteínas presentes nas células, assim como a quantificação absoluta e relativa destas proteínas. Outros projetos estão sendo elaborados visando à utilização desta ferramenta, principalmente no campo da oncologia clínica para diversas finalidades, como biomarcadores, sendo empregada para diferenciação do secretopeptidoma plasmático e identificação de modificações pós-transducionais de pacientes com câncer gástrico. Este tema é um projeto em colaboração com a Dra. Nora Manouikian Forones, professora Livre-docente da EPM/UNIFESP, na área médica com ênfase em gastrenterologia/cancerologia. Na vigência deste projeto temático (#12/50191-4), foram adquiridos um Nano-HPLC (Thermo) para ser acoplado ao um dispensador automático em placas de MALDI-TO/TOF (Proteineer FC, Bruker), e uma Workstation com programas de bioinformática (Peaks studio, Waterloo, Canadá; Profile Analysis e Protein Scape, Bruker Daltonics, Bremen, Alemanha) para análises proteômicas. Entretanto, este sistema não permite realizar os experimentos expostos acima. O objetivo desta solicitação é para viabilizar a compra do espectrômetro de massa Impact II (Bruker Alemanha), já cotado pela empresa responsável, a partir do recurso financeiro disponível no projeto sem acréscimo orçamentário, uma vez que a empresa fabricante do equipamento já viabilizou a venda de acordo com o recurso disponível. Este equipamento será multiusuário, uma vez que já ocorrem colaborações com diversos pesquisadores das áreas de pesquisa básica e clínica da Escola Paulista de Medicina, bem como pesquisadores da UNIFESP Campus - Diadema/SP, que anseiam pela possibilidade de explorar aplicações que esta ferramenta pode proporcionar. O sistema nanoLC acoplado ao espectrômetro de massas e softwares, pode realizar a identificação de proteínas (proteômica topdown e botton-up), sequenciamento e identificação de compostos inéditos, análises peptidômica e metabolômica, além de executar operações adicionais, tais quais análises quantitativas label-free, uma vez que é possível avaliação do cromatograma e intensidade/área dos íons precursores e todas as ferramentas de bioinformáticas são compatíveis com os dados adquiridos. Demandas na área de metabolômica também poderão ser utilizadas, uma vez que os nossos HPLCs são compatíveis com o sistema. Finalmente, é importante ressaltar que toda a infraestrutura instalada a partir deste projeto temático, já mencionado acima e acrescido com a aquisição do equipamento pleiteado fará parte de um amplo projeto de analises metabolômicas na rejeição de rins transplantados pelo Hospital do Rim, que executa de 900 a 950 transplantes/ano, sendo o centro de maior atividade de transplantes renais no mundo. Neste projeto, faremos a utilização de espectrometria de massas associada à Ressonância Nuclear Magnética (RMN) em metabolômica, cujo equipamento e infraestrutura acabaram de ser instalados no INFAR sob a coordenação da Dra. Helena Nader. Além disso, a Bruker, também fabricante do RMN, dará o suporte técnico e logístico para esta novidade tecnológica de associação MS/RMN. (AU)

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DO NASCIMENTO, EDILZA SILVA; ANAYA, KATYA; DE OLIVEIRA, JULIA MARIANO CAJU; DE LACERDA, JOSE THALLES JOCELINO GOMES; MILLER, MICHAEL EDWARD; DIAS, MERIELLEN; MENDES, MARIA ANITA; PALLONE, JULIANA DE AZEVEDO LIMA; ARNS, CLARICE WEIS; JULIANO, MARIA APARECIDA; et al. Identification of bioactive peptides released from in vitro gastrointestinal digestion of yam proteins (Dioscorea cayennensis). Food Research International, v. 143, MAY 2021. (12/50191-4, 18/13588-0)

FREIRE, MARJORIE C. L. C.; NOSKE, GABRIELA D.; BITENCOURT, NATALIA V.; SANCHES, PAULO R. S.; SANTOS-FILHO, NORIVAL A.; GAWRILJUK, VICTOR O.; DE SOUZA, EDUARDO P.; NOGUEIRA, VICTOR H. R.; DE GODOY, MARIANA O.; NAKAMURA, ALINE M.; et al. Non-Toxic Dimeric Peptides Derived from the Bothropstoxin-I Are Potent SARS-CoV-2 and Papain-like Protease Inhibitors. Molecules, v. 26, n. 16, AUG 2021. (18/17095-8, 20/04602-9, 13/07600-3, 20/05761-3, 20/12519-4, 18/25600-4, 16/19712-9, 16/13884-2, 18/13588-0)

TELES, C. M.; LAMMOGLIA, L. C.; JULIANO, M. A.; RUIZ, A. L. T. G.; CANDIDO, T. Z.; DE CARVALHO, J. E.; LIMA, C. S. P.; ABBEHAUSEN, C.. Novel anticancer Pd-II complexes: The effect of the conjugation of transferrin binding peptide and the nature of halogen coordinated on antitumor activity. Journal of Inorganic Biochemistry, v. 199, OCT 2019. (17/12719-0, 18/13588-0, 16/07729-4)

GRACIOSO, LOUISE HASE; PENA-BAHAMONDE, JANIRE; KAROLSKI, BRUNO; BORREGO, BRUNA BACARO; PERPETUO, ELEN AQUINO; OLLER DO NASCIMENTO, CLAUDIO AUGUSTO; HASHIGUCHI, HIROKI; JULIANO, MARIA APARECIDA; ROBLES HERNANDEZ, FRANCISCO C.; RODRIGUES, DEBORA FRIGI. Copper mining bacteria: Converting toxic copper ions into a stable single-atom copper. SCIENCE ADVANCES, v. 7, n. 17, APR 2021. (15/18089-3, 18/22790-7, 13/11020-2, 13/50218-2, 18/13588-0)

NETO, OSCAR BENTO SILVA; VALLADAO, RODRIGO; COELHO, GUILHERME RABELO; DIAS, RENATA; PIMENTA, DANIEL CARVALHO; LOPES, ADRIANA RIOS. Spiders' digestive system as a source of trypsin inhibitors: functional activity of a member of atracotoxin structural family. SCIENTIFIC REPORTS, v. 13, n. 1, p. 13-pg., 2023-01-29. (15/23745-7, 18/13588-0)

DE OLIVEIRA, TALITA MENDES; JOCELINO GOMES DE LACERDA, JOSE THALLES; FIGUEIREDO LEITE, GIUSEPPE GIANINI; DIAS, MERIELLEN; MENDES, MARIA ANITA; KASSAB, PAULO; SALES E SILV, CLISLEYD GLAUCIELLY; JULIANO, MARIA APARECIDA; FORONES, NORA MANOUKIAN. Label-free peptide quantification coupled with in silico mapping of proteases for identification of potential serum biomarkers in gastric adenocarcinoma patients. CLINICAL BIOCHEMISTRY, v. 79, p. 61-69, MAY 2020. (18/13588-0, 12/50191-4)

BEZERRA, TALIANA; ESTEVEZ, MARIO; LACERDA, JOSE THALLES; DIAS, MERIELLEN; JULIANO, MARIA; MENDES, MARIA ANITA; MORGANO, MARCELO; PACHECO, MARIA TERESA; MADRUGA, MARTA. Chicken Combs and Wattles as Sources of Bioactive Peptides: Optimization of Hydrolysis, Identification by LC-ESI-MS2 and Bioactivity Assessment. Molecules, v. 25, n. 7, APR 2020. (18/13588-0, 12/50191-4)

ALENCAR BEZERRA, TALIANA KENIA; JOCELINO GOMES DE LACERDA, JOSE THALLES; SALU, BRUNO RAMOS; VILELA OLIVA, MARIA LUIZA; JULIANO, MARIA APARECIDA; PACHECO, MARIA TERESA BERTOLDO; MADRUGA, MARTA SUELY. Identification of Angiotensin I-Converting Enzyme-Inhibitory and Anticoagulant Peptides from Enzymatic Hydrolysates of Chicken Combs and Wattles. JOURNAL OF MEDICINAL FOOD, v. 22, n. 12, DEC 2019. (18/13588-0, 12/50191-4)

NISHIYAMA-JR, MILTON Y.; TASHIMA, ALEXANDRE K.; NISHIDUKA, ERIKA S.; ABREU, THIAGO F.; ABUKAWA, FERNANDA MIDORI; OLIVEIRA, URSULA C.; TARDIVO, CAIO E. O.; NASCIMENTO, SORAIA M.; MEISSNER, GABRIEL O.; CHAIM, OLGA M.; et al. Multiomics Profiling of Toxins in the Venom of the Amazonian Spider Acanthoscurria juruenicola. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 21, n. 11, p. 15-pg., 2022-10-19. (17/20106-9, 18/13588-0, 13/07467-1)