Diagnóstico da infecção pelo SARS-CoV2, em diferentes materiais biológicos, em pessoas infectadas por esse vírus

• Processo: 20/05623-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2023
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Maria Cássia Jacintho Mendes Corrêa
• Beneficiário: Maria Cássia Jacintho Mendes Corrêa
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Ana Luiza de Souza Bierrenbach ; Fabio Eudes Leal ; João Carlos da Silva Bizario ; Silvia Figueiredo Costa ; Tania Regina Tozetto Mendoza
• Assunto(s): Infecções por Coronavirus COVID-19 SARS-CoV-2 Materiais biológicos Secreções corporais Técnicas e procedimentos diagnósticos Testes sorológicos Pandemias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Covid 19 | diagnóstico | Material biológico | Sars-Cov2 | Doenças Infecciosas e Parasitárias

Resumo

De forma geral o diagnóstico da infecção pelo SARS-CoV-2 em todo o mundo, ocorre na fase aguda da doença e por meio da identificação do vírus em amostras coletadas por swab de nasofaringe e eventualmente saliva. Pouco se conhece sobre a presença desse agente em outros materiais biológicos e em diferentes fases da doença. Da mesma forma, pouco se conhece sobre a associação da excreção desse agente nessas secreções e a resposta imune-humoral. O esclarecimento dessas informações poderia auxiliar na compreensão da história natural da doença e auxiliar no diagnóstico e manejo desses pacientes, esclarecendo importantes aspectos da transmissão interpessoal, hospitalar e comunitária deste agente. Objetivos 1 - Investigar a presença do SARS-CoV-2 em swab de naso faringe, saliva, urina, sangue e fezes, durante a fase aguda e de convalescença da infecção em pacientes imunocompetentes e imunodeprimidos; 2 - Investigar a presença do SARS-CoV-2 em saliva ou swab de naso-faringe de contactantes de pacientes com Covid-19; 3 - Correlacionar a presença do SARS-CoV 2 nesses materiais biológicos e os títulos de anticorpos neutralizantes e anticorpos do tipo IgG por ELISA; 4 - Investigar a taxa de permanência e infectividade do SARS-CoV-2 nesses pacientes durante a fase aguda e de convalescença da COVID-19. Metodologia - Trata-se de um estudo observacional, prospectivo, a ser desenvolvido em pacientes e contactantes assintomáticos desses pacientes, atendidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP, Instituto do Câncer do Estado de São Paulo (ICESP) e no município de São Caetano do Sul, com diagnóstico de infecção pelo SARS-CoV-2. Serão incluídos 125 pacientes, divididos em 3 grupos de pacientes: 1 - Pacientes sintomáticos sem diagnóstico de qualquer imunodepressão prévia (50 pacientes); 2 - Pacientes sintomáticos com diagnóstico de tumores sólidos ou candidatos a Transplante de Células-tronco Hematopoiéticas (25 pacientes); 3 - Contactantes assintomáticos destes pacientes (qualquer grupo - 50 pacientes). Coletas de sangue, urina, saliva, e swabs de naso faringe e anal serão realizadas durante 5 semanas seguidas, com intervalos de uma semana (dias 1, 7, 14, 21, 28) a iniciar até 72 horas do momento do diagnóstico em todos os pacientes dos grupos 1 e 2. Para pacientes do grupo 3, será coletada apenas saliva e swab de naso faringe no dia 1. Para a detecção de anticorpos anti-SARS CoV 2, serão utilizadas as técnicas sorológicas de ELISA e o ensaio de neutralização. Para identificação viral serão utilizadas técnicas de biologia molecular e cultivo viral. Ensaios quantitativos duplex (controle interno e gene N ou E) para SARS-CoV-2 serão realizados segundo protocolos adaptados, com os iniciadores e sondas para o ensaio de PCR em tempo real. O isolamento viral será realizado em laboratório de segurança nível 3 (NB-3), e as amostras serão submetidas a isolamento em células VeroE6, sabidamente susceptíveis a Coronavirus. (AU)

Publicações científicas

(6)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MENDES CORREA, MARIA C.; LEAL, FABIO E.; VILLAS BOAS, LUCY S.; WITKIN, STEVEN S.; DE PAULA, ANDERSON; TOZETTO MENDONZA, TANIA R.; FERREIRA, NOELY E.; CURTY, GISLAINE; DE CARVALHO, PEDRO S.; BUSS, LEWIS F.; et al. Prolonged presence of replication-competent SARS-CoV-2 in mildly symptomatic individuals: A report of two cases. Journal of Medical Virology, v. 93, n. 9, p. 5603-5607, SEP 2021. (20/05623-0)

LUCY SANTOS VILLAS-BOAS; ANDERSON VICENTE DE PAULA; ALMIR RIBEIRO DA SILVA JR.; HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA PAIAO; TANIA REGINA TOZETTO-MENDOZA; ERIKA REGINA MANULI; FÁBIO EUDES LEAL; ANDREA DE BARROS COSCELLI FERRAZ; ESTER CERDEIRA SABINO; ANA LUIZA BIERRENBACH; et al. Absence of neutralizing antibodies against the Omicron SARS-CoV-2 variant in convalescent sera from individuals infected with the ancestral SARS-CoV-2 virus or its Gamma variant. Clinics, v. 77, 2022-08-08. (20/05623-0)

MENDES-CORREA, MARIA CASSIA; SALOMAO, MATIAS CHIARASTELLI; GHILARDI, FABIO; TOZETTO-MENDOZA, TANIA REGINA; SANTOS VILLAS-BOAS, LUCY; DE PAULA, ANDERSON VICENTE; PAIAO, HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LEAL, FABIO E.; FERRAZ, ANDREA DE BARROS COSCELLI; et al. SARS-CoV-2 Detection and Culture in Different Biological Specimens from Immunocompetent and Immunosuppressed COVID-19 Patients Infected with Two Different Viral Strains. Viruses-Basel, v. 15, n. 6, p. 12-pg., 2023-06-01. (20/05623-0)

DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; MENDES-CORREA, MARIA C.; TOZETTO-MENDOZA, TANIA REGINA; VILLAS-BOAS, LUCY S.; DE PAULA, ANDERSON VICENTE; PAIAO, HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA; LEAL, FABIO E.; FERREIRA, NOELY E.; HONORATO, LAYLA; LEAL, ELCIO; et al. Detailed characterization of Redondovirus in saliva of SARS-CoV-2-infected individuals in Sao Paulo, Brazil. PLoS One, v. 18, n. 8, p. 10-pg., 2023-08-31. (20/05623-0)

TOZETTO-MENDOZA, TANIA R. R.; MENDES-CORREA, MARIA CASSIA; LINHARES, IARA MORENO; RAYMUNDI, VANESSA DE CASSIA; PAIAO, HEUDER GUSTAVO DE OLIVEIRA; BARBOSA, ERICK MATHEUS GARCIA; LUNA-MUSCHI, ALESSANDRA; HONORATO, LAYLA; CORREA, GIOVANNA FRANCISCO; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; et al. Association between development of severe COVID-19 and a polymorphism in the CIAS1 gene that codes for an inflammasome component. SCIENTIFIC REPORTS, v. 13, n. 1, p. 5-pg., 2023-07-12. (20/05623-0)

MARIA CASSIA MENDES-CORREA; FÁBIO DE ROSE GHILARDI; MATIAS CHIARASTELLI SALOMÃO; LUCY SANTOS VILLAS-BOAS; ANDERSON VICENTE DE PAULA; HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA PAIAO; ANTONIO CHARLYS DA COSTA; TÂNIA REGINA TOZETTO-MENDOZA; WILTON FREIRE; FLAVIA CRISTINA SILVA SALES; et al. SARS-CoV-2 shedding, infectivity, and evolution in an immunocompromised adult patient. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 66, 2024-05-13. (18/14389-0, 20/05623-0)