Redes regulatórias envolvidas na modulação da deposição de gordura em suínos, identificadas por análise de coexpressão gênica

• Processo: 26/05778-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2026
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Aline Silva Mello Cesar
• Beneficiário: Aline Silva Mello Cesar
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Piracicaba
• Vinculado à bolsa: 22/10643-5 - Redes de co-expressão gênica associadas ao perfil de ácidos graxos do músculo esquelético e fígado de suínos alimentados com diferentes níveis e fontes de óleo, BP.DR
• Assunto(s): Biologia de sistemas Nutrigenômica Metabolismo dos lipídeos Sistema musculoesquelético
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Imf | lipid metabolism | pig model | skeletal muscle | Soybean oil | systems biology | Nutrigenômica

Resumo

Os mecanismos regulatórios subjacentes à interação entre os perfis de ácidos graxos (AG) e a expressão gênica são altamente complexos, envolvendo vias de sinalização e fatores de transcrição que controlam o metabolismo lipídico. Utilizando a abordagem de coexpressão gênica, podemos identificar reguladores gênicos chave e obter uma melhor compreensão das interações gênicas que podem desempenhar um papel importante nos mecanismos regulatórios. Portanto, este estudo visa identificar os mecanismos regulatórios da expressão gênica associados aos perfis de deposição de AG no músculo esquelético em diferentes dietas. Utilizamos dietas basais com diferentes níveis de óleo de soja (1,5% de óleo de soja [SOY1,5], dieta de referência; ou 3% de óleo de soja [SOY3,0], dieta enriquecida) adicionados durante as fases de crescimento e terminação em um estudo de 98 dias. O RNA total foi extraído e o mRNA foi sequenciado (Illumina). A análise bioinformática foi realizada com controle de qualidade, pré-processamento e alinhamento utilizando o programa Sus scrofa11.1. A abundância gênica foi normalizada para transcritos por milhão. Para identificar módulos coexpressos, utilizamos a análise de rede de coexpressão gênica ponderada (WGCNA) com dados de RNA-Seq e o perfil de ácidos graxos depositado. Após a filtragem, os dados de 33 suínos machos imunocastrados foram utilizados neste estudo. Para identificar as vias metabólicas e os termos de Gene Ontology (GO) afetados pela dieta enriquecida (com 3% de óleo de soja), foram utilizados os programas DAVID e REVIGO. Dietas com diferentes níveis de óleo de soja afetam os processos metabólicos de maneiras distintas. De modo geral, identificamos redes de coexpressão principalmente envolvidas no metabolismo lipídico, doenças e resposta geral relacionada a processos inflamatórios e homeostase da glicose. Construímos redes de coexpressão e identificamos os genes centrais, incluindo TPM1 e SLC38A10, bem como CSRNP1, TRIP10, ZFP30 e MYBPH. A análise de coexpressão utilizando WGCNA fornece novas perspectivas sobre a deposição de ácidos graxos, identificando genes candidatos potencialmente envolvidos na regulação lipídica e influenciados por diferenças dietéticas. (AU)