Caracterização molecular e funcional de proteínas que compõem o complexo spliceosomal em tripanosomatídeos

• Processo: 07/07476-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2008
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2010
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Pesquisador responsável: Regina Maria Barretto Cicarelli
• Beneficiário: Regina Maria Barretto Cicarelli
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCFAR). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 08/07761-9 - Caracterização molecular e funcional de proteínas que compõem o complexo spliceosomal em tripanosomatídeos, BP.TT
• Assunto(s): Trypanosoma brucei brucei Trypanosoma cruzi RNA mensageiro Ribonucleoproteínas nucleares pequenas RNA nuclear pequeno Spliceossomos Trans-splicing
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: snRNA | snRNP | spliceossomo | trans-splicing | Trypanasoma brucei | Trypanosoma cruzi | Biologia Molecular

Resumo

Em tripanosomatideos, o processo de trans-splicing é responsável pelo processamento dos pré-mRNAs policistronicos, resultando na individualização de cada gene, de modo que cada mRNA contenha a seqüência spliced leader (SL) na extremidade 5. Esse processo requer a participação das ribonucleoproteínas (snRNPs) U2, U4/U6, U5 e SL RNP, que são constituídas por snRNAs, 7 proteínas Sm (comuns a todos) e proteínas especificas de cada partícula. Através da produção in vivo e purificação da proteína SmD1-PTP tagged, foi possível a identificação de 41 proteínas que interagem com essa partícula, das quais 16 foram anotadas como proteínas conservadas hipotéticas. Dentre essas, já foi possível a identificação de um homólogo de proteína especifica U1-A, uma proteína Lsm, uma proteína U5 especifica e duas proteínas que não se ligam diretamente a esses snRNAs, mas que provavelmente participam do mecanismo como fatores de splicing. Sendo assim, este projeto propõe a caracterização molecular e funcional das outras 11 proteínas conservadas hipotéticas com o intuito de identificar novos possíveis pontos de ataque quimioterápico parasita-específico. Para isso serão utilizadas técnicas de PTP-tag, primer extension para a análise de ligação aos snRNAs, RNAi para a verificação da essencialidade para a sobrevivência do parasita e funcionalidade na reação de trans-splicing. Os dados obtidos serão importantes em futuros experimentos de avaliação de mecanismo de ação de substâncias tripanocidas na reação de trans-splicing em tripanosomas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

AMBROSIO, DANIELA LUZ; LEE, JU HUCK; PANIGRAHI, ASWINI K.; NGUYEN, TU NGOC; BARRETTO CICARELLI, REGINA MARIA; GUENZL, ARTHUR. Spliceosomal Proteomics in Trypanosoma brucei Reveal New RNA Splicing Factors. Eukaryotic Cell, v. 8, n. 7, p. 990-1000, JUL 2009. (07/07476-0)

DA SILVA, MARCO TULIO A.; AMBROSIO, DANIELA L.; TREVELIN, CAROLINE C.; WATANABE, TATIANA F.; LAURE, HELEN J.; GREENE, LEWIS J.; ROSA, JOSE C.; VALENTINI, SANDRO R.; CICARELLI, REGINA M. B.. New insights into trypanosomatid U5 small nuclear ribonucleoproteins. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 106, n. 2, p. 130-138, MAR 2011. (08/56226-9, 07/07476-0, 06/05766-8)