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Caracterização molecular e funcional de proteínas que compõem o complexo spliceosomal em tripanosomatídeos

Processo: 07/07476-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de julho de 2008 - 31 de dezembro de 2010
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
Pesquisador responsável:Regina Maria Barretto Cicarelli
Beneficiário:Regina Maria Barretto Cicarelli
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCFAR). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):08/07761-9 - Caracterização molecular e funcional de proteínas que compõem o complexo spliceosomal em tripanosomatídeos, BP.TT
Assunto(s):Trypanosoma brucei brucei  Biologia molecular  Trypanosoma cruzi  RNA mensageiro  Ribonucleoproteínas nucleares pequenas  RNA nuclear pequeno  Spliceossomos  Trans-splicing 

Resumo

Em tripanosomatideos, o processo de trans-splicing é responsável pelo processamento dos pré-mRNAs policistronicos, resultando na individualização de cada gene, de modo que cada mRNA contenha a seqüência spliced leader (SL) na extremidade 5. Esse processo requer a participação das ribonucleoproteínas (snRNPs) U2, U4/U6, U5 e SL RNP, que são constituídas por snRNAs, 7 proteínas Sm (comuns a todos) e proteínas especificas de cada partícula. Através da produção in vivo e purificação da proteína SmD1-PTP tagged, foi possível a identificação de 41 proteínas que interagem com essa partícula, das quais 16 foram anotadas como proteínas conservadas hipotéticas. Dentre essas, já foi possível a identificação de um homólogo de proteína especifica U1-A, uma proteína Lsm, uma proteína U5 especifica e duas proteínas que não se ligam diretamente a esses snRNAs, mas que provavelmente participam do mecanismo como fatores de splicing. Sendo assim, este projeto propõe a caracterização molecular e funcional das outras 11 proteínas conservadas hipotéticas com o intuito de identificar novos possíveis pontos de ataque quimioterápico parasita-específico. Para isso serão utilizadas técnicas de PTP-tag, primer extension para a análise de ligação aos snRNAs, RNAi para a verificação da essencialidade para a sobrevivência do parasita e funcionalidade na reação de trans-splicing. Os dados obtidos serão importantes em futuros experimentos de avaliação de mecanismo de ação de substâncias tripanocidas na reação de trans-splicing em tripanosomas. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DA SILVA, MARCO TULIO A.; AMBROSIO, DANIELA L.; TREVELIN, CAROLINE C.; WATANABE, TATIANA F.; LAURE, HELEN J.; GREENE, LEWIS J.; ROSA, JOSE C.; VALENTINI, SANDRO R.; CICARELLI, REGINA M. B. New insights into trypanosomatid U5 small nuclear ribonucleoproteins. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 106, n. 2, p. 130-138, MAR 2011. Citações Web of Science: 4.
AMBROSIO, DANIELA LUZ; LEE, JU HUCK; PANIGRAHI, ASWINI K.; NGUYEN, TU NGOC; BARRETTO CICARELLI, REGINA MARIA; GUENZL, ARTHUR. Spliceosomal Proteomics in Trypanosoma brucei Reveal New RNA Splicing Factors. Eukaryotic Cell, v. 8, n. 7, p. 990-1000, JUL 2009. Citações Web of Science: 35.

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