Análise do perfil da expressão gênica em Cochiliomyia hominivorax através de sequenciamento massivo em paralelo

• Processo: 08/58106-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2011
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Tatiana Teixeira Torres
• Beneficiário: Tatiana Teixeira Torres
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética molecular Biologia computacional Sequenciamento de nova geração Expressão gênica Ectoparasitoses animal Cochliomyia hominivorax Bovinocultura
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Ectoparasitismo | Expressao Genica | Genomica Funcional | Praga Da Pecuaria | Sequenciamento De Nova Geracao

Resumo

O Brasil possui uma das maiores populações de gado do mundo e tem um papel importante no cenário mundial como produtor e exportador de uma grande variedade de produtos pecuários. Doenças parasitárias afetam profundamente a produtividade animal e a venda de animais vivos ou derivados e, conseqüentemente, representam um grande impacto no desenvolvimento do setor agropecuário no país. A mosca da bicheira, Cochliomyia hominivorax (Coquerel) é um dos principais agentes causadores de miíases traumáticas na região Neotropical e as infestações causadas por suas larvas representam graves prejuízos econômicos para a produção animal. Apesar da importância de C. hominivorax como praga da pecuária e de sua biologia peculiar, muito pouco se conhece sobre seu genoma e genética molecular básica. Sendo assim, o objetivo deste projeto é desenvolver e avaliar o potencial de uma nova estratégia para caracterizar o padrões de expressão gênica em amostras de C. hominivorax, utilizando uma das técnicas de sequenciamento de nova geração, a tecnologia Solexa/Ilumina. Esta nova técnica vem revolucionando análises em escala genômica por gerar resultados mais rapidamente e apresentar custos reduzidos quando comparada ao sequenciamento tradicional. Além disso, esta a estratégia proposta é promissora por superar as limitações inerentes aos "microarrays", por não basear-se na hibridização de ácidos nucleicos. Este é apenas primeiro e fundamental passo para uma série de novos projetos de conhecimento de base e aplicado, como a caracterização de genes ou famílias gênicas relacionadas ao hábito de parasitismo ou resistência a inseticidas. Espera-se que os resultados obtidos, estejam na dianteira no campo de genética molecular e forneçam os dados de base para uma série de projetos inovadores. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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TANDONNET, SOPHIE; TORRES, TATIANA TEIXEIRA. Traditional versus 3 ' RNA-seq in a non-model species. GENOMICS DATA, v. 11, p. 8-pg., 2017-03-01. (13/00243-0, 08/58106-0, 12/06819-9)

LE GALL, VALERIA LIS; KLAFKE, GUILHERME MARCONDES; TORRES, TATIANA TEIXEIRA. Detoxification mechanisms involved in ivermectin resistance in the cattle tick, Rhipicephalus (Boophilus) microplus. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, AUG 17 2018. (08/58106-0, 12/06819-9)

CARDOSO, GISELE ANTONIAZZI; TONUS MARINHO, MARCO ANTONIO; MONFARDINI, RAQUEL DIETSCHE; LIMA DE AZEREDO ESPIN, ANA MARIA; TORRES, TATIANA TEIXEIRA. Evolution of genes involved in feeding preference and metabolic processes in Calliphoridae (Diptera: Calyptratae). PeerJ, v. 4, OCT 27 2016. (12/19987-7, 08/58106-0, 14/13933-8, 12/23200-2, 09/51723-7, 09/13463-3, 14/01600-4)