Busca avançada
Ano de início
Entree

Estudos de associação genômica das características reprodutivas de touros zebuínos (Bos indicus) utilizando SNP chip de alta densidade

Processo: 10/52030-2
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2011
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
Pesquisador responsável:José Fernando Garcia
Beneficiário:José Fernando Garcia
Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária (FMVA). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araçatuba. Araçatuba , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):12/19570-9 - Estudo de associação genômica das carcterísticas reprodutivas de touros zebuínos (Bos indcus) utilizando SNP chip de alta densidade, BP.TT
Assunto(s):Genomas  Melhoramento genético animal  Bovinos 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bovino | Genomica | Reproducao | Selecao | Snp Chip | Zebu

Resumo

Diversos estudos realizados nas áreas de genética quantitativa e genômica funcional demonstraram que a Associação Genômica (do inglês: Genome Wide Association Study - GWAS) permite a identificação de marcadores moleculares passíveis de uso nos processos de seleção, potencializando o ganho genético dos programas de melhoramento genético. Essa técnica pode permitir a identificação de marcadores genéticos associados a fenótipos específicos, tais como qualidade do sêmen e criotolerância espermática, úteis na seleção precoce, eficiente e confiável de reprodutores, aumentando assim a produtividade e a rentabilidade da pecuária bovina. O emprego de ferramentas moleculares avançadas, como o chip de polimorfismo de sítio único (SNP chip), tem maximizado os benefícios da seleção assistida por marcadores, permitindo a varredura uniforme do genoma para milhares de marcadores simultaneamente e propiciando a obtenção de mapas genômicos densos extremamente informativos. Levando em consideração a necessidade atual da cadeia produtiva bovina em encurtar os ciclos de produção pela seleção de animais superiores com melhor desempenho reprodutivo em idades precoces, o presente projeto propõe a identificação de marcadores moleculares associados à qualidade do sêmen e criotolerância espermática em touros de raças zebuínas utilizando SNP chip de alta densidade. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Mais itensMenos itens
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas (17)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AGUIAR, TAMIRIS SAYURI; PINTOR TORRECILHA, RAFAELA BEATRIZ; MILANESI, MARCO; HARTH UTSUNOMIYA, ADAM TAITI; TRIGO, BEATRIZ BATISTA; TIJJANI, ABDULFATAI; MUSA, HASSAN HUSSEIN; LOPES, FLAVIA LOMBARDI; AJMONE-MARSAN, PAOLO; CARVALHEIRO, ROBERTO; et al. Association of Copy Number Variation at Intron 3 of HMGA2 With Navel Length in Bos indicus. FRONTIERS IN GENETICS, v. 9, . (14/01095-8, 16/07531-0, 16/05787-7, 10/52030-2, 17/08373-1)
NEVES, HAROLDO H. R.; CARVALHEIRO, ROBERTO; PEREZ O'BRIEN, ANA M.; UTSUNOMIYA, YURI T.; DO CARMO, ADRIANA S.; SCHENKEL, FLAVIO S.; SOELKNER, JOHANN; MCEWAN, JOHN C.; VAN TASSELL, CURTIS P.; COLE, JOHN B.; et al. Accuracy of genomic predictions in Bos indicus (Nellore) cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 46, . (10/52030-2, 11/16643-2, 10/06185-4)
UTSUNOMIYA, YURI T.; DO CARMO, ADRIANA S.; CARVALHEIRO, ROBERTO; NEVES, HAROLDO H. R.; MATOS, MARCIA C.; ZAVAREZ, LUDMILLA B.; O'BRIEN, ANA M. PEREZ; SOELKNER, JOHANN; MCEWAN, JOHN C.; COLE, JOHN B.; et al. Genome-wide association study for birth weight in Nellore cattle points to previously described orthologous genes affecting human and bovine height. BMC GENETICS, v. 14, . (10/52030-2, 11/16643-2)
PORTO-NETO, LAERCIO R.; SONSTEGARD, TAD S.; LIU, GEORGE E.; BICKHART, DEREK M.; DA SILVA, MARCOS V. B.; MACHADO, MARCO A.; UTSUNOMIYA, YURI T.; GARCIA, JOSE F.; GONDRO, CEDRIC; VAN TASSELL, CURTIS P.. Genomic divergence of zebu and taurine cattle identified through high-density SNP genotyping. BMC Genomics, v. 14, . (10/52030-2)
UTSUNOMIYA, YURI TANI; MILANESI, MARCO; HARTH UTSUNOMIYA, ADAM TAITI; PINTOR TORRECILHA, RAFAELA BEATRIZ; KIM, EUI-SOO; COSTA, MARCIO SILVA; AGUIAR, TAMIRIS SAYURI; SCHROEDER, STEVEN; DO CARMO, ADRIANA SANTANA; CARVALHEIRO, ROBERTO; et al. A PLAG1 mutation contributed to stature recovery in modern cattle. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (10/52030-2, 16/07531-0, 14/01095-8)
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; MESZAROS, GABOR; UTSUNOMIYA, YURI T.; SONSTEGARD, TAD S.; GARCIA, J. FERNANDO; VAN TASSELL, CURTIS P.; CARVALHEIRO, ROBERTO; DA SILVA, MARCOS V. B.; SOLKNER, JOHANN. Linkage disequilibrium levels in Bos indicus and Bos taurus cattle using medium and high density SNP chip data and different minor allele frequency distributions. LIVESTOCK SCIENCE, v. 166, p. 12-pg., . (11/16643-2, 10/52030-2)
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; MESZAROS, GABOR; UTSUNOMIYA, YURI T.; SONSTEGARD, TAD S.; GARCIA, J. FERNANDO; VAN TASSELL, CURTIS P.; CARVALHEIRO, ROBERTO; DA SILVA, MARCOS V. B.; SOLKNER, JOHANN. Linkage disequilibrium levels in Bos indicus and Bos taurus cattle using medium and high density SNP chip data and different minor allele frequency distributions. LIVESTOCK SCIENCE, v. 166, n. SI, p. 121-132, . (10/52030-2, 11/16643-2)
BOISON, S. A.; NEVES, H. H. R.; PEREZ O'BRIEN, A. M.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARVALHEIRO, R.; DA SILVA, M. V. G. B.; SOELKNER, J.; GARCIA, J. F.. Imputation of non-genotyped individuals using genotyped progeny in Nellore, a Bos indicus cattle breed. LIVESTOCK SCIENCE, v. 166, n. SI, p. 176-189, . (10/52030-2, 11/16643-2)
UTSUNOMIYA, YURI TANI; O'BRIEN, ANA MARIA PEREZ; SONSTEGARD, TAD STEWART; VAN TASSELL, CURTIS PAUL; DO CARMO, ADRIANA SANTANA; MESZAROS, GABOR; SOELKNER, JOHANN; GARCIA, JOSE FERNANDO. Detecting Loci under Recent Positive Selection in Dairy and Beef Cattle by Combining Different Genome-Wide Scan Methods. PLoS One, v. 8, n. 5, . (10/52030-2, 11/16643-2)
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; UTSUNOMIYA, YURI T.; MESZAROS, GABOR; BICKHART, DEREK M.; LIU, GEORGE E.; VAN TASSELL, CURTIS P.; SONSTEGARD, TAD S.; DA SILVA, MARCOS V. B.; GARCIA, JOSE FERNANDO; SOELKNER, JOHANN. Assessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 46, . (10/52030-2, 11/16643-2)
UTSUNOMIYA, YURI T.; CARMO, ADRIANA S.; NEVES, HAROLDO H. R.; CARVALHEIRO, ROBERTO; MATOS, MARCIA C.; ZAVAREZ, LUDMILLA B.; ITO, PIER K. R. K.; O'BRIEN, ANA M. PEREZ; SOELKNER, JOHANN; PORTO-NETO, LAERCIO R.; et al. Genome-Wide Mapping of Loci Explaining Variance in Scrotal Circumference in Nellore Cattle. PLoS One, v. 9, n. 2, . (10/52030-2, 11/16643-2)
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; HOELER, DANIELA; BOISON, SOLOMON A.; MILANESI, MARCO; BOMBA, LORENZO; UTSUNOMIYA, YURI T.; CARVALHEIRO, ROBERTO; NEVES, HAROLDO H. R.; DA SILVA, MARCOS V. B.; VANTASSELL, CURTIS P.; et al. Low levels of taurine introgression in the current Brazilian Nelore and Gir indicine cattle populations. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 47, . (10/52030-2, 14/01095-8)
UTSUNOMIYA, YURI TANI; PINTOR TORRECILHA, RAFAELA BEATRIZ; MILANESI, MARCO; PAULAN, SILVANA DE CASSIA; HARTH UTSUNOMIYA, ADAM TAITI; GARCIA, JOSE FERNANDO. Hornless Nellore cattle (Bos indicus) carrying a novel 110 kbp duplication variant of the polled locus. ANIMAL GENETICS, v. 50, n. 2, p. 2-pg., . (16/05787-7, 10/52030-2, 17/08373-1)
BOISON, S. A.; NEVES, H. H. R.; PEREZ O'BRIEN, A. M.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARVALHEIRO, R.; DA SILVA, M. V. G. B.; SOELKNER, J.; GARCIA, J. F.. Imputation of non-genotyped individuals using genotyped progeny in Nellore, a Bos indicus cattle breed. LIVESTOCK SCIENCE, v. 166, p. 14-pg., . (11/16643-2, 10/52030-2)
UTSUNOMIYA, Y. T.; FORTUNATO, A. A. A. D.; MILANESI, M.; TRIGO, B. B.; ALVES, N. F.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F.. Bos taurus haplotypes segregating in Nellore (Bos indicus) cattle. ANIMAL GENETICS, v. 53, n. 1, . (10/52030-2)
UTSUNOMIYA, ADAM T. H.; SANTOS, DANIEL J. A.; BOISON, SOLOMON A.; UTSUNOMIYA, YURI T.; MILANESI, MARCO; BICKHART, DEREK M.; AJMONE-MARSAN, PAOLO; SOELKNER, JOHANN; GARCIA, JOSE F.; DA FONSECA, RICARDO; et al. Revealing misassembled segments in the bovine reference genome by high resolution linkage disequilibrium scan. BMC Genomics, v. 17, . (10/52030-2, 14/01095-8)
TRIGO, BEATRIZ B.; UTSUNOMIYA, ADAM T. H.; FORTUNATO, ALVARO A. A. D.; MILANESI, MARCO; TORRECILHA, RAFAELA B. P.; LAMB, HARRISON; NGUYEN, LOAN; ROSS, ELIZABETH M.; HAYES, BEN; PADULA, ROMULO C. M.; et al. Variants at the ASIP locus contribute to coat color darkening in Nellore cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 53, n. 1, . (10/52030-2, 16/05787-7)