Rastreamento de fatores de transcrição envolvidos na regulação da Hemoglobina Fetal por Footprinting Filogenético

• Processo: 15/09456-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Claudia Regina Bonini Domingos
• Beneficiário: Claudia Regina Bonini Domingos
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Regulação da expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Beta-hemoglobinopathies | Fetal Hemoglobin | Phylogenetic Footprinting | transcription factors | Regulação Gênica

Resumo

A Hemoglobina Fetal (Hb F) é um importante modulador genético das beta-hemoglobinopatias. A regulação dos níveis da Hb F é influenciada por fatores de transcrição. Nós utilizamos o footprinting filogenético para rastrear fatores de transcrição que apresentam sítios de ligação nas regiões não-codificantes dos genes HBG1 e HBG2 a fim de identificar os determinantes genéticos que atuam na expressão da Hb F. Nossas análises mostraram 354 motifs de fatores de transcrição conservados nas regiões não-codificantes do gene HBG1 e 231 motifs no gene HBG2 entre as espécies analisadas. Dentre eles, 13 mostraram relação com a regulação da Hb F: CDC5, c-MYB, CP2, GATA-1, GATA-2, NF-E2, NF-Y, RUNX-1, TAL-1, YY1, BP1, COUP-TFII e PAX-1, sendo que os três últimos elementos foram conservados apenas nas regiões não-codificantes do gene HBG1. O conhecimento dos elementos genéticos envolvidos na manutenção de altos níveis de Hb F podem fornecer novas estratégias terapêuticas eficientes no tratamento das beta-hemoglobinopatias, promovendo redução das complicações clínicas dessas afecções genéticas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE SOUZA CARROCINI, GISELE CRISTINE; RODRIGUES VENANCIO, LARISSA PAOLA; BONINI-DOMINGOS, CLAUDIA REGINA. Screening of Transcription Factors Involved in Fetal Hemoglobin Regulation Using Phylogenetic Footprinting. EVOLUTIONARY BIOINFORMATICS, v. 11, p. 239-244, 2015. (15/09456-2, 11/15570-1)