Padronização de estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) baseado em pools de DNA e alelotipagem em arrays de alta densidade em bovinos

• Processo: 12/17153-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Heidge Fukumasu
• Beneficiário: Francisco José de Novais
• Instituição Sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia molecular Herdabilidade Animais domésticos Nucleotídeos Análise estatística de dados Gado Nelore Estudo de associação genômica ampla
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: DNA Pool | Gwas | habilidade materna | Nelore | Precocidade sexual | Biologia Molecular aplicada a produção animal

Resumo

Em função da maior demanda de carne bovina dos próximos anos, devem-se aumentar a taxa de desfrute na produção brasileira, investindo principalmente em tecnologia e serviços. No que tange a tecnologia, deve-se aumentar a eficiência em características produtivas e reprodutivas, porém essas são limitadas pelas baixas a moderadas herdabilidades e alto custo de mensuração com acurácias significativas. A busca por características reprodutivas de baixo custo é de suma importância sendo que uma delas é a idade ao primeiro parto onde não há custos adicionais na produção para mensurá-la. Porém, esta ainda é limitada à baixa herdabilidade, alta influência ambiental e apresenta relativa correlação positiva com o peso do bezerro desmamado. Porém com o avanço da biotecnologia, atualmente é possível identificar associações fenotípicas entre centenas de loci genômicos, permitindo verificar o quanto da variabilidade de uma característica fenotípica é provinda do genoma conhecido, através dessa análise estatística de polimorfismos de nucleotídeos únicos (do inglês, Single Nucleotide Polymorphism, SNP) espaçados uniformemente pelo genoma presentes em microarranjos de DNA. Com isso pode-se determinar tais marcadores com maior influência sobre o fenótipo para utilização como característica auxiliar dentro de programas de melhoramento. Desta maneira, o objetivo desse trabalho é padronizar um modelo experimental para estudos iniciais de GWAS (também conhecidos como GWAS de fase 1), baseando o estudo em pools DNA de animais que determinem grupos de alta e baixa eficiência quanto à idade ao primeiro parto e maior peso do bezerro desmamado (corrigido para 210 dias).(AU)