| Processo: | 14/08420-1 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica |
| Data de Início da vigência: | 01 de julho de 2014 |
| Data de Término da vigência: | 31 de julho de 2014 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal |
| Pesquisador responsável: | Danillo Pinhal |
| Beneficiário: | Arthur Casulli de Oliveira |
| Supervisor: | Simon Moxon |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Genome Analysis Centre, Inglaterra |
| Vinculado à bolsa: | 13/03644-6 - Análise do transcriptoma de microRNAs no tecido cardíaco da Tilápia do Nilo utilizando RNA-seq e genômica comparativa, BP.IC |
| Assunto(s): | RNAs não codificadores Tecidos (anatomia) Morfologia (anatomia) Evolução biológica |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Cardiac Tissue | non-coding RNA | Target Genes | Non-coding RNA |
Resumo O coração sofreu diversas mudanças morfológicas levando a um aumento de complexidade funcional durante a evolução dos vertebrados. Atualmente, tais mudanças na complexidade morfológica são reconhecidas como sendo resultado de distintos perfis de expressão de genes de RNAs codificadores e não-codificadores (ncRNAs). Dentre os ncRNAs, microRNAs (miRNAs) têm sido descritos como reguladores chave em diversos processos biológicos, incluindo a regulação de genes associados ao desenvolvimento e manutenção cardíaca. Esta abundante classe de pequenos RNAs age silenciando seus genes alvos, ultimamente inibindo a função proteica. Neste sentido, o estudo dos miRNAs expressos no coração cardíaco da tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus), cujo genoma foi completamente sequenciado, torna-se relevante para o entendimento dos padrões de organização genômica, dos níveis de expressão e da dinâmica evolutiva dos miRNAs nos vertebrados, assim como permitem a descoberta de novos miRNAs com funções desconhecidas. No projeto atualmente em execução (FAPESP - 13/03644-6), utilizando o RNA-seq e ferramentas de bioinformática, foram encontrados mais de uma centena de miRNAs expressos no coração da tilápia do Nilo. Desse total, foram identificados dez miRNAs altamente expressos, o que sugere sua direta participação na regulação da expressão gênica em células cardíacas. Neste projeto, a ser desenvolvido no TGCA Centre, UK, propõe-se a realização de uma análise aprofundada dos miRNAS altamente expressos a fim de identificar seus alvos, e subsequentemente determinar a organização genômica e respectivas vias reguladas por estes genes alvo, utilizando ferramentas de bioinformática robustas e atualizadas. Os resultados gerados serão por si só informativos, bem como se constituirão no ponto de partida para a validação das interações dos miRNAs com seus alvos utilizando experimentos de genética reversa. (AU) | |
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