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Análise de miRNAs altamente expressos no coração da Tilápia do Nilo utilizando bioinformática

Processo: 14/08420-1
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de julho de 2014
Vigência (Término): 31 de julho de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Danillo Pinhal
Beneficiário:Arthur Casulli de Oliveira
Supervisor no Exterior: Simon Moxon
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Local de pesquisa : Genome Analysis Centre, Inglaterra  
Vinculado à bolsa:13/03644-6 - Análise do transcriptoma de microRNAs no tecido cardíaco da Tilápia do Nilo utilizando RNA-seq e genômica comparativa, BP.IC
Assunto(s):RNAs não codificadores   Tecidos (anatomia)   Morfologia (anatomia)   Evolução biológica

Resumo

O coração sofreu diversas mudanças morfológicas levando a um aumento de complexidade funcional durante a evolução dos vertebrados. Atualmente, tais mudanças na complexidade morfológica são reconhecidas como sendo resultado de distintos perfis de expressão de genes de RNAs codificadores e não-codificadores (ncRNAs). Dentre os ncRNAs, microRNAs (miRNAs) têm sido descritos como reguladores chave em diversos processos biológicos, incluindo a regulação de genes associados ao desenvolvimento e manutenção cardíaca. Esta abundante classe de pequenos RNAs age silenciando seus genes alvos, ultimamente inibindo a função proteica. Neste sentido, o estudo dos miRNAs expressos no coração cardíaco da tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus), cujo genoma foi completamente sequenciado, torna-se relevante para o entendimento dos padrões de organização genômica, dos níveis de expressão e da dinâmica evolutiva dos miRNAs nos vertebrados, assim como permitem a descoberta de novos miRNAs com funções desconhecidas. No projeto atualmente em execução (FAPESP - 13/03644-6), utilizando o RNA-seq e ferramentas de bioinformática, foram encontrados mais de uma centena de miRNAs expressos no coração da tilápia do Nilo. Desse total, foram identificados dez miRNAs altamente expressos, o que sugere sua direta participação na regulação da expressão gênica em células cardíacas. Neste projeto, a ser desenvolvido no TGCA Centre, UK, propõe-se a realização de uma análise aprofundada dos miRNAS altamente expressos a fim de identificar seus alvos, e subsequentemente determinar a organização genômica e respectivas vias reguladas por estes genes alvo, utilizando ferramentas de bioinformática robustas e atualizadas. Os resultados gerados serão por si só informativos, bem como se constituirão no ponto de partida para a validação das interações dos miRNAs com seus alvos utilizando experimentos de genética reversa. (AU)

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