Investigando variações e funções de pequenos RNAs não-codificantes em Oreochromis niloticus

Resumo

A tilápia do Nilo é uma importante espécie de ciclídeo africano que apresenta rápida irradiação adaptativa e importância econômica, principalmente na aquicultura brasileira. Diferentes características morfológicas e fisiológicas da tilápia do Nilo podem influenciar a sua produção, como o sexo, a tolerância à água de má qualidade e o comportamento alimentar. Pequenos RNAs não codificantes podem ser fatores importantes subjacentes a estas características que influenciam a produção da tilápia do Nilo. Enquanto alguns tipos de pequenos RNAs não codificantes podem regular a expressão génica (microRNAs [miRNAs]), outros podem evitar a ocorrência de mutações no genoma nocivas à celulas germinativas causadas por elementos transponíveis (PIWI-interacting RNAs [piRNAs]). Portanto, o entendimento do impacto dos miRNAs e piRNAs nos aspectos morfológicos e fisiológicos de peixes adultos e nos estágios de desenvolvimento de embriões é fundamental para produção de Tilápia. Por estas razões, é proposto neste projeto a construção de um catálogo em larga escala de miRNAs e piRNAs juntamente com seus tecidos e estágios embrionários, assinaturas de expressão gênica e funções biológicas. No que diz respeito especificamente a miRNAs, serão analisadas isoformas e ocorrência de eventos de arm switching. E para piRNAs será determinado como identificar, classificar e quantificar estas moléculas antes da construção do catálogo. Para atingir os objetivos mencionados acima, serão utilizadas abordagens de bioinformática, como análise de agrupamentos, análises de redes biológicas e enriquecimento funcional. Além disso, para a identificação de piRNAs serão utilizados métodos de aprendizagem de máquina previamente desenvolvidos. Finalmente, um catálogo de miRNAs e piRNAs será contruido e poderá ser usado para compreender como os pequenos RNAs influenciam os aspectos morfológicos e fisiológicos da tilápia e possíveis processos biotecnológicos de melhoramento genético. (AU)