Análise do transcriptoma de microRNAs no tecido cardíaco da tilápia do Nilo utilizando RNA-seq e genômica comparativa

Resumo

MicroRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs não codificadores (~22 nucleotídeos) que regulam pós-transcricionalmente a expressão de RNAs mensageiros alvo controlando, assim, a produção de proteínas. Nos vertebrados, o envolvimento de miRNAs no controle do crescimento, desenvolvimento, resposta ao estresse e regeneração, dentre outros processos essenciais, têm sido demonstrado em vários órgãos, incluindo o coração. Ainda, a associação observada entre abundância e diversidade de miRNAs e aumento de complexidade do grupo taxonômico tornaram os miRNAs elementos relevantes tanto no entendimento da evolução de genes e mecanismos regulatórios, através de análises genômicas intraespecíficas, quanto como marcadores filogenéticos em investigações genômicas comparativas. Nos peixes, maior grupo de vertebrados viventes, dentre as ~30.000 espécies conhecidas apenas um pequeno número foi investigado quanto à composição e perfis de expressão de miRNAs. No presente projeto propõe-se o uso de sequenciamento de alta performance ("deep sequencing" ou RNA-seq) combinado à análise genômica comparativa com o objetivo de investigar a organização genômica, a diversidade e a dinâmica evolutiva do conjunto de miRNAs expressos no tecido cardíaco, utilizando como modelo biológico a tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus), que possui genoma completo sequenciado. A partir desses experimentos, será possível identificar combinações de miRNAs e RNAs mensageiros alvos e associá-los à evolução do genoma e à regulação de processos biológicos específicos. Destaca-se que a presente proposta está vinculada a um amplo projeto para caracterização de miRNAs, atualmente em desenvolvimento (Auxílio Regular à Pesquisa FAPESP - 2012/15589-7).