Filogeografia comparada de quatro complexos de espécies de aves amazônicas: reconstruindo processos biogeográficos a partir do sequenciamento de elementos ultra conservados

• Processo: 14/00113-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2014
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Cristina Yumi Miyaki
• Beneficiário: Gregory Thom e Silva
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 12/50260-6 - Estruturação e evolução da biota amazônica e seu ambiente: uma abordagem integrativa, AP.BTA.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/12551-7 - Filogeografia comparada de três complexos de espécies de aves restritas a ambientes de várzea: abordando novos padrões biogeográficos para a Amazônia, BE.EP.DR
• Assunto(s): Biologia molecular Biogeografia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia molecular | Hipóteses biogeográficas | Histórico evolutivo | Thamnophilidae | várzea | Biologia evolutiva/ filogeografia

Resumo

A utilização da biologia molecular aplicada à biogeografia amazônica tem contribuindo consideravelmente para o entendimento de como processos históricos moldaram a elevada diversidade deste Bioma. O desenvolvimento desta disciplina tem permitido relacionar de forma crescente aspectos evolutivos a processos analíticos, mudando consideravelmente os métodos de análise e a interpretação dos dados genéticos. Dessa forma, hoje é possível realizar uma ampla amostragem ao longo do genoma para reconstruir o histórico evolutivo de uma linhagem. Apesar de algumas hipóteses biogeográficas proporem cenários distintos para a formação da biodiversidade Amazônica, é consenso que eventos simultâneos de isolamento ou dispersão seguidos de divergência, possibilitaram a existência sintópica de linhagens distintas. Nesse contexto, trabalhos filogeográficos comparativos podem contribuir para um melhor entendimento dos processos paleoambientais e paleoclimáticos que levaram à formação e à estruturação da biodiversidade atual. Assim, foram selecionadas três linhagens (complexos de espécies) da família Thamnophilidae (Thamnophilus nigrocinereus, Myrmoborus lugubris e Myrmotherula assimilis), como modelos para a realização de um estudo filogeográfico comparativo. Os modelos selecionados são restritos as grandes várzeas do Rio Amazonas e outros tributários, um ambiente pouco estudado em abordagens filogeográficas. Para tanto, serão capturadas sequências de Elementos Ultra Conservados (EUC), obtidos por sequenciamento de nova geração, e de genes mitocondriais pela metodologia de Sanger. Analisem filogenéticas e populacionais baseadas em estimativas empíricas e a partir de computação bayesiana aproximada serão realizadas no intuito de gerar um cenário temporal e espacial para cada linhagem com o objetivo de responder: 1) Como em um contexto espacial e temporal o padrão de diversificação das linhagens estudadas foi formado? 2) Existem sobreposições espaciais e temporais nos processos de diversificação dos complexos de espécies trabalhados? 3) Quais eventos paleoambientais e paleoclimáticos podem explicar os cenários de diversificação encontrados? (AU)

Publicações científicas

(6)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DO AMARAL, FABIO RAPOSO; MALDONADO-COELHO, MARCOS; ALEIXO, ALEXANDRE; LUNA, LEILTON W.; DO REGO, PERICLES SENA; ARARIPE, JULIANA; SOUZA, THAINARA O.; SILVA, WEBER A. G.; THOM, GREGORY. Recent chapters of Neotropical history overlooked in phylogeography: Shallow divergence explains phenotype and genotype uncoupling in Antilophia manakins. Molecular Ecology, v. 27, n. 20, p. 4108-4120, OCT 2018. (13/50297-0, 17/25720-7, 14/00113-2, 15/18287-0, 15/12551-7, 16/11439-1, 11/23155-4, 11/50143-7)

SILVA, SOFIA MARQUES; TOWNSEND PETERSON, A.; CARNEIRO, LINCOLN; TORTOLA BURLAMAQUI, TIBERIO CESAR; RIBAS, CAMILA C.; SOUSA-NEVES, TIAGO; MIRANDA, LEONARDO S.; FERNANDES, ALEXANDRE M.; D'HORTA, FERNANDO M.; ARAUJO-SILVA, LUCAS EDUARDO; et al. A dynamic continental moisture gradient drove Amazonian bird diversification. SCIENCE ADVANCES, v. 5, n. 7, JUL 2019. (14/00113-2, 12/50260-6)

THOM, GREGORY; XUE, ALEXANDER T.; SAWAKUCHI, ANDRE O.; RIBAS, CAMILA C.; HICKERSON, MICHAEL J.; ALEIXO, ALEXANDRE; MIYAKI, CRISTINA. Quaternary climate changes as speciation drivers in the Amazon floodplains. SCIENCE ADVANCES, v. 6, n. 11, MAR 2020. (13/50297-0, 17/25720-7, 14/00113-2, 18/17869-3, 12/50260-6, 15/12551-7)

CHOUERI, ERIK L.; GUBILI, CHRYSOULA; BORGES, SERGIO H.; THOM, GREGORY; SAWAKUCHI, ANDRE O.; SOARES, EMILIO A. A.; RIBAS, CAMILA C.. Phylogeography and population dynamics of Antbirds (Thamnophilidae) from Amazonian fluvial islands. Journal of Biogeography, v. 44, n. 10, p. 2284-2294, OCT 2017. (15/12551-7, 14/00113-2, 11/06609-1, 12/50260-6)

THOM, GREGORY; DO AMARAL, FABIO RAPOSO; HICKERSON, MICHAEL J.; ALEIXO, ALEXANDRE; ARAUJO-SILVA, LUCAS E.; RIBAS, CAMILA C.; CHOUERI, ERIK; MIYAKI, CRISTINA Y.. Phenotypic and Genetic Structure Support Gene Flow Generating Gene Tree Discordances in an Amazonian Floodplain Endemic Species. Systematic Biology, v. 67, n. 4, p. 700-718, JUL 2018. (11/50143-7, 15/12551-7, 13/50297-0, 14/00113-2, 11/23155-4, 12/50260-6)

THOM, GREGORY; RIBAS, CAMILA C.; SHULTZ, EDUARDO; ALEIXO, ALEXANDRE; MIYAKI, CRISTINA Y.. Population dynamics of Amazonian floodplain forest species support spatial variation on genetic diversity but not range expansions through time. Journal of Biogeography, v. 49, n. 10, p. 11-pg., 2022-09-08. (14/00113-2, 13/50297-0, 15/12551-7, 17/25720-7, 12/50260-6, 18/17869-3)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SILVA, Gregory Thom e. Filogeografia comparada de aves de várzea baseada em sequências de elementos ultra conservados: reconstruindo padrões biogeográficos da Amazônia. 2018. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências (IBIOC/SB) São Paulo.