| Processo: | 16/04963-6 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de maio de 2016 |
| Data de Término da vigência: | 09 de agosto de 2018 |
| Área de conhecimento: | Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química |
| Pesquisador responsável: | Munir Salomao Skaf |
| Beneficiário: | Gabriel Heerdt |
| Instituição Sede: | Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID |
| Assunto(s): | Simulação de dinâmica molecular Celulase Hidrólise enzimática Bioenergia Teoria do funcional da densidade Métodos ab initio |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | bioenergia | Celulases | Dinamica de Proteinas | Dinâmica Molecular | Hidrólise enzimática | métodos DFT e ab initio | Química teórica computacional |
Resumo O bolsista deverá aplicar técnicas modernas de simulações de DM para estudar proteínas de interesse para a conversão de biomassa celulósica em açúcares solúveis simples. O nosso interesse é o de explorar a ligação proteína-substrato em nível atomístico para compreender os mecanismos de hidrólise catalítica dos polissacarídeos. Para tal, propomos a aplicação de métodos DFT e QM/MM a polissacarídeos ancorados nos sítios ativos correspondentes das enzimas.Abordagens semelhantes poderão ser usadas para estudar reações de fosforilação e acetilação em outras proteínas, especialmente de receptores nucleares, que constituem uma importante classe de proteínas que o nosso grupo tem estudado durante quase uma década.Mapas de correlação generalizada em complexos de proteínas também são de interesse do nosso Centro de Cepid, em especial sobre NRs e outros reguladores do fator de transcrição. Recentemente, obtivemos resultados importantes relativos a mecanismos alostéricos em NRs usando correlações generalizadas e análise de conectividade para o complexo completo PPARg/RXR/DNA. Aqui propomos uma extensão natural e importante deste trabalho, investigando mapas de conectividade no complexo inovador CRISPR/Cas. (AU) | |
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