Padronização de primers de bactérias relacionadas com acidose usando PCR em tempo real e análise da biodiversidade microbiana ruminal

• Processo: 16/18302-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 15 de novembro de 2016
• Data de Término da vigência: 16 de agosto de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Nutrição e Alimentação Animal
• Pesquisador responsável: Telma Teresinha Berchielli
• Beneficiário: Pablo de Souza Castagnino
• Supervisor: Jeffrey L. Firkins
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Ohio State University, Columbus, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 15/03918-4 - Glicerina bruta associada com virginiamicina em dietas ricas em carboidratos não fibrosos sobre o desempenho e parâmetros fermentativos de novilhos nelore, BP.DR
• Assunto(s): Dieta animal Acidose Fermentação ruminal Diversidade microbiana Reação em cadeia da polimerase em tempo real
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Acidose | diversidade microbiana | pcr em tempo real | Mestrado

Resumo

A acidose ruminal é uma desordem metabólica causada por excessiva fermentação de dietas ricas em concentrados que aumentam a produção de ácidos orgânicos. O aumento na produção de ácidos graxos de cadeia curta pode reduzir o pH ruminal abaixo de 6,0 e aumentar o crescimento de Streptococcus bovis e Lactobacillus spp (bactéria produtoras de ácido lático). O uso de glicerina bruta combinado com virginiamicina poderia aumentar a captação de lactato pelas bactérias Megasphaera elsdenii e Selenomoas ruminantium e reduzir a produção de Streptococcus bovis e Lactobacillus spp.,o que poderia atenuar o risco de acidose e aumentar o desempenho animal. O estágio no exterior tem por objetivo padronizar os primers de Megasphaera elsdenii, Selenomonas ruminantium, Streptococcus bovis Lactobacillus spp usando PCR em tempo real(qpCR) e aprender técnicas moleculares de análise de biodiversidade em microrganismos. ruminais. Para isso, será utilizado primers da literatura relacionado a tese " Glicerina bruta combinado virginiamicina em dietas ricas em carboidratos não fibrosos sobre o desempenho e parâmetros ruminais de novilhos Nelore" (FAPESP-2015/03918-4) e serão desenvolvidos trabalhos com diferentes técnicas moleculares para análise da biodiversidade microbiana ruminal no Departamento de Animal Science da universidade de Ohio. O candidato irá padronizar os primers usados em sua tese no laboratório do professor Jeffrey Firkins e terá oportunidade de seguir estudos de quantificação de microrganismos ruminais os quais poderão ser utilizados futuramente no seu grupo de pesquisa. (AU)