Determinação do RNA global processado em células suprerexpressando SF1 por RNA-seq

• Processo: 17/23589-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Leticia Fröhlich Archangelo
• Beneficiário: Guilherme Brussolo Bidoia
• Supervisor: Philipp Greif
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Ludwig Maximilian University of Munich (LMU Munich), Alemanha
• Vinculado à bolsa: 16/03982-7 - Clonagem de SF1 selvagem e portador das mutações G372V e T454M em vetor retroviral bicistrônico e produção de retrovírus, BP.IC
• Assunto(s): Leucemia-linfoma linfoblástico de células precursoras Análise de sequência de RNA Fatores de processamento de RNA Mutação Superexpressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: leukemia | RNA-seq | Sf1 | splicing | Zfm1 | Biologia Celular e Molecular

Resumo

O Splicing Factor 1 (SF1) está localizado no cromossomo 11q13. Esse gene codifica uma proteína que contém um motivo ULM, domínios coiled-coil e KH-QUA2, seguido por um zinc knuckle e uma região rica em prolina. SF1 reconhece a sequência de ramificação do intron, interage com subunidades U2AF e sinaliza os primeiros passos da montagem do spliceosomo. No splicing alternativo, SF1 rege seletivamente um subconjunto de introns. Além disso, o SF1 desempenha um papel na retenção pré-mRNA e na repressão transcripcional. Recentemente, mutações somáticas em SF1 foram relatadas em pacientes com síndromes mielodisplásicas, leucemia mielóide aguda de novo e neoplasias mieloproliferativas. Além disso, os dados preliminares do nosso grupo mostram uma maior expressão de SF1 em pacientes com leucemia linfoblástica aguda. Para obter mais informações sobre a função SF1 e as consequências de suas mutações G372V e T454M em leucemia, temos como objetivo investigar os alvos globais de splicing e transcrição de SF1 em células leucemicas que superexpressam as formas de SF1 selvagem e mutantes. (AU)