Construção e caracterização de um sistema replicon sub-genômico do ZIKV para a descoberta de agentes antivirais.

• Processo: 18/05130-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2018
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Glaucius Oliva
• Beneficiário: Rafaela Sachetto Fernandes
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07600-3 - CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos, AP.CEPID
• Assunto(s): Biologia celular Flavivirus Descoberta de drogas Vírus Zika Replicon
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Descoberta de drogas | flavivírus | replicon | Zika | Biologia celular

Resumo

Um surto de febre zika atingiu as Américas em 2015 e se tornou uma grande epidemia em 2016, levando a Organização Mundial da Saúde (OMS) a declarar estado de emergência internacional. No Brasil, o vírus Zika (ZIKV) tem sido associado a malformações congênitas e doenças neurológicas graves, como a microcefalia e a síndrome de Guillain-Barré. Considerando o risco de outra epidemia do ZIKV e a ausência de tratamento efetivo e profilático contra o vírus, o desenvolvimento de ensaios antivirais rápidos e confiáveis que permitam a análise de grandes bibliotecas de compostos é um grande desafio para a descoberta de drogas anti-ZIKV. O replicon é um sistema sub-genômico auto-replicante no qual os genes que codificam as proteínas estruturais do vírus são substituídos por um gene repórter, como uma luciferase ou uma proteína fluorescente. Os efeitos inibitórios dos compostos na replicação do RNA viral podem ser facilmente avaliados medindo-se a redução dos sinais luminescentes ou fluorescentes. O objetivo do projeto proposto é a construção e a caracterização de um replicon do ZIKV expressando o gene repórter da Renilla luciferase (Rluc). Utilizaremos técnicas de biologia molecular padrão, como PCR e clonagens, para montar o cassete de expressão do replicon contendo o gene Rluc, e inseri-lo no plasmídeo pUC57 de propagação em E. coli junto a um promotor T7. Uma vez obtido o plasmídeo com a construção do replicon, iremos transfectar células de mamíferos (linhagem BHK) com o mRNA proveniente dessa cepa. A expressão das proteínas virais será avaliada por imunofluorescência indireta e a competência de replicação do replicon será analisada pela medida de atividade da luciferase. Uma vez padronizada, essa linhagem celular será base para os testes de novos agentes antivirais em nosso laboratório. Este projeto está vinculado ao projeto CEPID CIBFar da FAPESP, e tem também como objetivo estabelecer uma base para estudos de vários vírus em nosso laboratório.

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; DE GODOY, ANDRE SCHUTZER; SANTOS, IGOR ANDRADE; NOSKE, GABRIELA DIAS; DE OLIVEIRA, KETLLYN IRENE ZAGATO; GAWRILJUK, VICTOR OLIVEIRA; JARDIM, ANA CAROLINA GOMES; OLIVA, GLAUCIUS. Discovery of an imidazonaphthyridine and a riminophenazine as potent anti-Zika virus agents through a replicon-based high-throughput screening. VIRUS RESEARCH, v. 299, JUL 2 2021. (18/05130-3, 16/19712-9, 13/07600-3)

FERNANDES, RAFAELA S.; NOSKE, GABRIELA D.; GAWRILJUK, VICTOR O.; DE OLIVEIRA, KETLLYN I. Z.; GODOY, ANDRE S.; MESQUITA, NATHALYA C. M. R.; OLIVA, GLAUCIUS. High-throughput Antiviral Assays to Screen for Inhibitors of Zika Virus Replication. JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, v. N/A, n. 176, p. 11-pg., 2021-10-01. (13/07600-3, 16/19712-9, 18/05130-3)

FERNANDES, RAFAELA S.; FREIRE, MARJORIE C. L. C.; BUENO, V, RENATA; GODOY, ANDRE S.; GIL, LAURA H. V. G.; OLIVA, GLAUCIUS. Reporter Replicons for Antiviral Drug Discovery against Positive Single-Stranded RNA Viruses. Viruses-Basel, v. 12, n. 6, JUN 2020. (16/19712-9, 18/05130-3, 13/07600-3, 18/17095-8)

NOSKE, GABRIELA DIAS; GAWRILJUK, VICTOR OLIVEIRA; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; FURTADO, NATHALIA DIAS; BONALDO, MYRNA CRISTINA; OLIVA, GLAUCIUS; GODOY, ANDRE SCHUTZER. Structural characterization and polymorphism analysis of the NS2B-NS3 protease from the 2017 Brazilian circulating strain of Yellow Fever virus. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1864, n. 4, APR 2020. (16/19712-9, 18/05130-3, 13/07600-3)

DE GODOY, ANDRE SCHUTZER; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; CAMPOS AGUIAR, ANNA CAROLINE; BUENO, RENATA VIEIRA; DE MORAES ROSO MESQUITA, NATHALYA CRISTINA; CARVALHO GUIDO, RAFAEL VICTORIO; OLIVA, GLAUCIUS. Structural and mechanistic insight from antiviral and antiparasitic enzyme drug targets for tropical infectious diseases. CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY, v. 59, p. 65-72, DEC 2019. (16/19712-9, 18/05130-3, 13/07600-3, 15/18192-9)

FREIRE, MARJORIE C. L. C.; BASSO, LUIS G. M.; MENDES, LUIS F. S.; MESQUITA, NATHALYA C. M. R.; MOTTIN, MELINA; FERNANDES, RAFAELA S.; POLICASTRO, LUCCA R.; GODOY, ANDRE S.; SANTOS, IGOR A.; RUIZ, URIEL E. A.; et al. Characterization of the RNA-dependent RNA polymerase from Chikungunya virus and discovery of a novel ligand as a potential drug candidate. SCIENTIFIC REPORTS, v. 12, n. 1, p. 15-pg., 2022-06-22. (18/17095-8, 18/05130-3, 15/16812-0, 21/10465-7, 13/07600-3, 17/24669-8, 21/01706-0)

RUIZ, URIEL ENRIQUE AQUINO; SANTOS, IGOR ANDRADE; GROSCHE, VICTORIA RIQUENA; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; GODOY, ANDRE SCHUTZER DE; TORRES, JHOAN DAVID AGUILLON; FREIRE, MARJORIE CAROLINE LIBERATO CAVALCANTI; MESQUITA, NATHALYA CRISTINA DE MORAES ROSO; GUEVARA-VEGA, MARCO; NICOLAU-JUNIOR, NILSON; et al. Imidazonaphthyridine effects on Chikungunya virus replication: Antiviral activity by dependent and independent of interferon type 1 pathways. VIRUS RESEARCH, v. 324, p. 14-pg., 2023-01-03. (13/07600-3, 16/19712-9, 18/05130-3)

POLICASTRO, LUCCA R.; DOLCI, ISABELA; GODOY, ANDRE S.; SILVA JUNIOR, JOSE V. J.; RUIZ, URIEL E. A.; SANTOS, IGOR A.; JARDIM, ANA C. G.; SAMBY, KIRANDEEP; BURROWS, JEREMY N.; WELLS, TIMOTHY N. C.; et al. The Antifungal Itraconazole Is a Potent Inhibitor of Chikungunya Virus Replication. Viruses-Basel, v. 14, n. 7, p. 12-pg., 2022-07-01. (18/05130-3, 13/07600-3)

PUHL, ANA C.; FERNANDES, RAFAELA S.; GODOY, ANDRE S.; GIL, LAURA H. V. G.; OLIVA, GLAUCIUS; EKINS, SEAN. The protein disulfide isomerase inhibitor 3-methyltoxoflavin inhibits Chikungunya virus. Bioorganic & Medicinal Chemistry, v. 83, p. 8-pg., 2023-03-20. (13/07600-3, 18/05130-3)