Identificação de novos efetores secretados pelo T6SS de Salmonella utilizando abordagens in silico e caracterização funcional de um candidato

• Processo: 21/02536-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2021
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Ethel Bayer Santos
• Beneficiário: Andre Luiz de Araújo Silva
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/02178-2 - Função de sistemas de secreção do tipo VI de bactérias patogênicas na interação com células eucarióticas, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Virulência Genomas Salmonella
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Competição bacteriana | genômica comparativa | Salmonella | Sistema de secreção do tipo 6 | Toxinas | Patogênese bacteriana

Resumo

Bactérias vivem em comunidades polimicrobianas e competem constantemente por recursos. Espécies Gram-negativas como Salmonella sp. codificam um sistema de secreção de proteínas do tipo VI (T6SS), que constitui um aparato contrátil formado por 13 proteínas capaz de injetar proteínas tóxicas (efetores) dentro de bactérias competidoras, induzindo sua morte. O gênero Salmonella codifica cinco T6SS filogeneticamente distintos a partir de diferentes ilhas de patogenicidade: Salmonella Typhimurium codifica um SPI-6 T6SS; S. Gallinarum codifica um SPI-19 T6SS; S. arizonae codifica SPI-20 e SPI-21 T6SSs; e S. bongori codifica um SPI-22 T6SS. Foi demonstrada a importância dos sistemas SPI-6 e SPI-19 T6SSs para infecção de hospedeiros susceptíveis; no entanto, até hoje apenas dois efetores foram descritos sendo secretados pelo SPI-6 T6SS. A identificação de novos efetores dos T6SSs e a caracterização de seus mecanismos permitirão entender a contribuição desses sistemas para patogenicidade de Salmonella e a manutenção de reservatórios ambientais. Este projeto pretende utilizar uma série de abordagens bioinformáticas para identificar o repertório de efetores do T6SS codificado em 10K genomas de Salmonella. Após obtermos uma lista de prováveis candidatos, uma proteína com domínio de função desconhecida será escolhida para caracterização funcional. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SIBINELLI-SOUSA, STEPHANIE; DE ARAUJO-SILVA, ANDRE LUIZ; HESPANHOL, JULIA TAKUNO; ETHEL, BAYER-SANTOS. Revisiting the steps of Salmonella gut infection with a focus on antagonistic interbacterial interactions. FEBS Journal, OCT 2021. (18/04553-8, 19/27644-1, 18/25316-4, 17/02178-2, 21/02536-1)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SILVA, Andre Luiz de Araújo. Caracterização de um novo grupo de efetores pertencente a superfamília NlpC/P60 secretados pelo T6SS de Salmonella spp.. 2022. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.