Identificação de novos efetores secretados pelo T6SS de Salmonella utilizando abordagens in silico e caracterização funcional de um candidato

Resumo

Bactérias vivem em comunidades polimicrobianas e competem constantemente por recursos. Espécies Gram-negativas como Salmonella sp. codificam um sistema de secreção de proteínas do tipo VI (T6SS), que constitui um aparato contrátil formado por 13 proteínas capaz de injetar proteínas tóxicas (efetores) dentro de bactérias competidoras, induzindo sua morte. O gênero Salmonella codifica cinco T6SS filogeneticamente distintos a partir de diferentes ilhas de patogenicidade: Salmonella Typhimurium codifica um SPI-6 T6SS; S. Gallinarum codifica um SPI-19 T6SS; S. arizonae codifica SPI-20 e SPI-21 T6SSs; e S. bongori codifica um SPI-22 T6SS. Foi demonstrada a importância dos sistemas SPI-6 e SPI-19 T6SSs para infecção de hospedeiros susceptíveis; no entanto, até hoje apenas dois efetores foram descritos sendo secretados pelo SPI-6 T6SS. A identificação de novos efetores dos T6SSs e a caracterização de seus mecanismos permitirão entender a contribuição desses sistemas para patogenicidade de Salmonella e a manutenção de reservatórios ambientais. Este projeto pretende utilizar uma série de abordagens bioinformáticas para identificar o repertório de efetores do T6SS codificado em 10K genomas de Salmonella. Após obtermos uma lista de prováveis candidatos, uma proteína com domínio de função desconhecida será escolhida para caracterização funcional. (AU)