Identificação de carioferinas envolvidas na importação nuclear das subunidades do exossomo em Saccharomyces cerevisiae

• Processo: 22/00071-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Carla Columbano de Oliveira
• Beneficiário: Valdir Gomes Neto
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/00901-1 - Controle pós-transcricional de expressão gênica: processamento de pré-rRNA, degradação de mRNA, splicing e montagem de snoRNPs em Saccharomyces cerevisiae, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/16740-2 - Entendendo os mecanismos de transporte nuclear das subunidades do exossomo de RNA em Saccharomyces cerevisiae, BE.EP.PD
• Assunto(s): Transporte ativo do núcleo celular Exossomos Carioferinas Processamento de RNA Saccharomyces cerevisiae Eucariotos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: carioferinas | complexo Ski | degradação de RNA | Exossomo | processamento de RNA | transporte nuclear | Transporte Nuclear do Complexo Exossomo

Resumo

O complexo exossomo é uma das maquinarias mais versáteis de degradação de RNA em eucariotos, desempenhando papel relevante na biogênese de diversos RNAs (rRNAs, snoRNAs, snRNAs, ncRNAs) e na regulação dos níveis de expressão de mRNA específicos tanto no núcleo quanto no citoplasma. O exossomo atua em várias etapas diferentes de processamento e degradação de RNA possuindo atividade exoribonucleolítica 3'-5' que está envolvida no processamento e degradação de todos os tipos de RNA. Em eucariotos, dependendo da localização na célula, o exossomo pode variar em sua composição e forma de ação e ter substratos diferentes: o exossomo nuclear participa da maturação de diversos RNAs e na degradação de pré-mRNAs instáveis. Já no citoplasma, o exossomo está envolvido no controle dos níveis de mRNA na célula e na degradação de mRNAs aberrantes. O complexo exossomo é formado por dez subunidades no citoplasma (Exo10) e onze subunidades no núcleo (Exo11). Das onze subunidades, somente Rrp6 (exclusivamente nuclear) e Rrp44 têm atividade catalítica e cada uma se liga em lados opostos do core do complexo. No citoplasma, o exossomo interage com o complexo Ski através de Ski7 para o reconhecimento e degradação de RNAs aberrantes. No núcleo, o exossomo é altamente concentrado no nucléolo, onde o pré-rRNA é transcrito e o processamento é iniciado. Apesar da função do exossomo já ter sido extensivamente estudada, não se tem um conhecimento detalhado dos mecanismos de transporte para o núcleo, ou retenção no citoplasma. O presente projeto propõe o estudo do transporte do exossomo para o núcleo através da identificação das carioferinas responsáveis por esse processo e a investigação da importância do complexo Ski em manter o exossomo no citoplasma utilizando a levedura Saccharomyces cerevisiae como modelo de eucariotos nesses estudos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

NETO, VALDIR GOMES; CEPEDA, LEIDY PAOLA P.; QUEIROZ, BRUNO R. S.; CANTALOUBE, SYLVAIN; LEGER-SILVESTRE, ISABELLE; MANGEAT, THOMAS; ALBERT, BENJAMIN; GADAL, OLIVIER; OLIVEIRA, CARLA C.. New insights into nuclear import and nucleolar localization of yeast RNA exosome subunits. MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL, v. 36, n. 6, p. 20-pg., 2025-06-01. (22/16740-2, 20/00901-1, 22/00071-4)