Atacando a dengue em duas frentes: usando simulações computacionais para desenvolver novos compostos antivirais e vacinas

• Processo: 22/00347-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Pesquisa
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada
• Pesquisador responsável: Alexandre Suman de Araujo
• Beneficiário: Alexandre Suman de Araujo
• Pesquisador Anfitrião: Walter Rocchia
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Istituto Italiano di Tecnologia (IIT), Itália
• Assunto(s): Anticorpos neutralizantes Vírus da dengue Física biológica Energia livre Simulação de dinâmica molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anticorpos Neutralizantes | Cálculos de Energia Livre | Dinâmica Molecular a pH Constante | Dinâmica molecular no equilíbrio | peptídeo de fusão | Vírus da Dengue | Física Biológica

Resumo

A dengue é uma das arboviroses mais importantes que afetam humanos, transmitida principalmente por mosquitos fêmeas do gênero Aedes, infectando cerca de 390 milhões de indivíduos anualmente e levando a 500.000 hospitalizações. A causa da dengue é um vírus envelopado de forma esférica pertencente à família Flaviviridae. A proteína do envelope (proteína E) é uma proteína viral crucial porque é o único alvo dos anticorpos neutralizantes e contém uma sequência de aminoácidos chamada peptídeo de fusão. Em sua conformação fusogênica, a proteína E forma projeções na superfície do vírus expondo o peptídeo de fusão que interage com a membrana endossômica, levando à injeção do material genético do vírus na célula. O potente anticorpo amplamente neutralizante 752-2 C8 (C8) é eficaz contra os quatro sorotipos do vírus da dengue e seus determinantes de reconhecimento estão em locais invariantes entre os sorotipos na interface do dímero da proteína E, incluindo a cadeia principal exposta do peptídeo de fusão da proteína E. Explorar a natureza das interações que governam esses sistemas pode contribuir significativamente para o desenvolvimento de compostos antivirais e vacinas. Neste projeto, propomos o uso de simulações computacionais para investigar essas interações usando Dinâmica Molecular no equilíbrio (MD), cálculos de energia livre e Dinâmica Molecular a pH Constante (CpHMD). (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CASTELUCI, G.; DIAS, R. V. R.; MARTINS, I. B. S.; FERNANDES, R. A.; TEDESCO, J. A.; CARUSO, I. P.; DE ARAUJO, A. S.; ITRI, R.; MELO, F. A.. Grb2 Y160F mutant mimics the wild-type monomeric state dynamics and the monomer-dimer equilibrium. International Journal of Biological Macromolecules, v. 279, p. 9-pg., 2024-08-30. (22/00347-0, 16/13884-2, 23/09642-7, 19/24974-0, 23/01632-2, 23/01744-5)

MARTINS, INGRID B. S.; VIEGAS, RAFAEL G.; SANCHES, MURILO N.; DE ARAUJO, ALEXANDRE S.; LEITE, VITOR B. P.. Probing Mastoparan-like Antimicrobial Peptides Interaction with Model Membrane Through Energy Landscape Analysis. Journal of Physical Chemistry B, v. 128, n. 1, p. 9-pg., 2023-12-30. (22/00347-0, 23/02219-1, 21/15028-4)

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