Atacando a dengue em duas frentes: usando simulações computacionais para desenvolver novos compostos antivirais e vacinas

• Processo: 22/00347-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Pesquisa
• Vigência (Início): 01 de fevereiro de 2023
• Vigência (Término): 31 de julho de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada
• Pesquisador responsável: Alexandre Suman de Araujo
• Beneficiário: Alexandre Suman de Araujo
• Pesquisador Anfitrião: Walter Rocchia
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Istituto Italiano di Tecnologia (IIT), Itália
• Assunto(s): Anticorpos neutralizantes Vírus da dengue Física biológica Energia livre Simulação de dinâmica molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anticorpos Neutralizantes | Cálculos de Energia Livre | Dinâmica Molecular a pH Constante | Dinâmica molecular no equilíbrio | peptídeo de fusão | Vírus da Dengue | Física Biológica

Resumo

A dengue é uma das arboviroses mais importantes que afetam humanos, transmitida principalmente por mosquitos fêmeas do gênero Aedes, infectando cerca de 390 milhões de indivíduos anualmente e levando a 500.000 hospitalizações. A causa da dengue é um vírus envelopado de forma esférica pertencente à família Flaviviridae. A proteína do envelope (proteína E) é uma proteína viral crucial porque é o único alvo dos anticorpos neutralizantes e contém uma sequência de aminoácidos chamada peptídeo de fusão. Em sua conformação fusogênica, a proteína E forma projeções na superfície do vírus expondo o peptídeo de fusão que interage com a membrana endossômica, levando à injeção do material genético do vírus na célula. O potente anticorpo amplamente neutralizante 752-2 C8 (C8) é eficaz contra os quatro sorotipos do vírus da dengue e seus determinantes de reconhecimento estão em locais invariantes entre os sorotipos na interface do dímero da proteína E, incluindo a cadeia principal exposta do peptídeo de fusão da proteína E. Explorar a natureza das interações que governam esses sistemas pode contribuir significativamente para o desenvolvimento de compostos antivirais e vacinas. Neste projeto, propomos o uso de simulações computacionais para investigar essas interações usando Dinâmica Molecular no equilíbrio (MD), cálculos de energia livre e Dinâmica Molecular a pH Constante (CpHMD). (AU)