Potencial de regulação de lncRNA no metabolismo lipídico do músculo e fígado de suínos alimentados com diferentes níveis e fontes de óleo

• Processo: 22/10780-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Situação: Interrompido
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Aline Silva Mello Cesar
• Beneficiário: Bruna Pereira Martins da Silva
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/25180-2 - Efeito da adição de ácido oléico na dieta de suínos sobre o perfil da resposta imunológica e de ácidos graxos de diferentes tecidos, AP.JP
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/19019-8 - Potencial de regulação de lncRNAs no metabolismo lipídico hepático de suínos alimentados com diferentes níveis e fontes de óleo, BE.EP.DR
• Assunto(s): Ácidos graxos Biologia computacional Expressão gênica diferencial Modelos animais Transcriptoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ácidos graxos | bioinformática | Co-expressão | expressão diferencial | Metabolismo de Lipídios | Modelo Animal | Genômica Funcional e Nutrigenômica

Resumo

Os lipídios atuam como moléculas de sinalização, participam de diversos processos e são importantes para todos os tipos de células. O fígado e o músculo esquelético, são dois dos principais tecidos responsáveis pelo metabolismo de lipídios, processo complexo e dinâmico, que envolve diversos reguladores transcricionais. Os lncRNA são reguladores-chave no metabolismo, apresentam papel chave em relação a lipídios e têm sido amplamente estudados em modelos animais como os suínos. Com isso, o objetivo deste estudo é identificar lncRNA, vias e redes associadas ao metabolismo de lipídios e verificar o potencial de regulação no músculo e fígado de suínos alimentados com diferentes níveis e fontes de óleo. Para este projeto, serão utilizados dados de 72 suínos machos, provenientes de um estudo com período experimental de 98 dias. Os tratamentos experimentais consistiram de dietas de milho e farelo de soja contendo 1,5% de óleo de soja (SOY1.5), ou 3,0% de óleo de soja (SOY3.0), ou 3,0% de óleo de canola (CO), ou 3,0% de óleo de peixe (FO). A partir dos dados de RNA-seq (n = 72) os lncRNA serão identificados e quantificados, será realizada a análise de expressão diferencial pelo pacote estatístico DESeq2. A análise de co-expressão e associação com fenótipos de interesse (perfil de ácidos graxos, desempenho e eficiência animal), será realizado através do pacote do R WGCNA. A análise de enriquecimento funcional e análise de redes serão realizados pelos softwares DAVID e Cytoscape. Os resultados esperados deste estudo possuem perfil tecnológico e de inovação, uma vez que podem fornecer uma compreensão mais aprofundada dos processos que ligam os lncRNA ao metabolismo de lipídios, utilizando suínos como um modelo animal relevante.