Aprimorando a bioatividade de bacteriocinas de tipo pediocina por meio de abordagens in silico moleculares e estruturais.

• Processo: 23/17741-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Ricardo Pinheiro de Souza Oliveira
• Beneficiário: Iago Rodrigues Blanco
• Supervisor: Matheus Mendonca Pereira
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universidade de Coimbra (UC), Portugal
• Vinculado à bolsa: 22/07304-4 - Acessando a lógica molecular associada à presença, à regulação e à bioatividade de bacteriocinas presentes em comunidades microbianas de trato gastrointestinal de suínos por abordagens in silico e in vitro, BP.DD
• Assunto(s): Análise in silico Bacteriocinas Bioatividade Peptídeos catiônicos antimicrobianos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: análise in silico | bacteriocinas | bioatividade | peptídeos antimicrobianos | simulações moleculares | Bioinformática estrutural

Resumo

Bacteriocinas são peptídeos antimicrobianos naturalmente produzidos por algumas bactérias ácido lácticas, destacados por suas atividades inibitórias, especialmente contra alguns patógenos transmitidos por alimentos, como a Listeria, para a qual as bacteriocinas de tipo pediocina se destacam como agentes antimicrobianos. No entanto, ainda há muito a ser aprimorado para otimizar essa estratégia como substituta de antibióticos. A análise da sequência e estrutura das bacteriocinas por meio de métodos in silico permite a identificação de peptídeos e seus alvos moleculares para simulação de interações, com o objetivo de melhorar suas bioatividades. O presente estudo inclui a análise comparativa de múltiplas sequências de bacteriocinas do tipo pediocina, seu modelamento molecular, mecânica e dinâmica, identificação de alvos moleculares e propostas de modificações estruturais. Para isso, modelos tridimensionais serão construídos, energias de ligação calculadas e dinâmicas moleculares simuladas. Pretendemos obter informações sobre a diversidade de sequências, motivos funcionais, identificação de alvos, estados conformacionais e filogenia de bacteriocinas e bactérias produtoras, a fim de propor modificações estruturais para o aprimoramento da atividade antimicrobiana. Assim, esses peptídeos estudados podem ajudar a economizar recursos e proporcionar maior eficiência no combate a patógenos relevantes para a indústria de alimentos e saúde pública. Isso representa um passo notável na busca por aplicações probióticas, visando melhorar a qualidade dos alimentos e a saúde global