Bolsa 23/17741-5 - Análise in silico, Bacteriocinas - BV FAPESP
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Aprimorando a bioatividade de bacteriocinas de tipo pediocina por meio de abordagens in silico moleculares e estruturais.

Processo: 23/17741-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 01 de abril de 2024
Data de Término da vigência: 31 de março de 2025
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Ricardo Pinheiro de Souza Oliveira
Beneficiário:Iago Rodrigues Blanco
Supervisor: Matheus Mendonca Pereira
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Universidade de Coimbra (UC), Portugal  
Vinculado à bolsa:22/07304-4 - Acessando a lógica molecular associada à presença, à regulação e à bioatividade de bacteriocinas presentes em comunidades microbianas de trato gastrointestinal de suínos por abordagens in silico e in vitro, BP.DD
Assunto(s):Análise in silico   Bacteriocinas   Bioatividade   Peptídeos catiônicos antimicrobianos
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:análise in silico | bacteriocinas | bioatividade | peptídeos antimicrobianos | simulações moleculares | Bioinformática estrutural

Resumo

Bacteriocinas são peptídeos antimicrobianos naturalmente produzidos por algumas bactérias ácido lácticas, destacados por suas atividades inibitórias, especialmente contra alguns patógenos transmitidos por alimentos, como a Listeria, para a qual as bacteriocinas de tipo pediocina se destacam como agentes antimicrobianos. No entanto, ainda há muito a ser aprimorado para otimizar essa estratégia como substituta de antibióticos. A análise da sequência e estrutura das bacteriocinas por meio de métodos in silico permite a identificação de peptídeos e seus alvos moleculares para simulação de interações, com o objetivo de melhorar suas bioatividades. O presente estudo inclui a análise comparativa de múltiplas sequências de bacteriocinas do tipo pediocina, seu modelamento molecular, mecânica e dinâmica, identificação de alvos moleculares e propostas de modificações estruturais. Para isso, modelos tridimensionais serão construídos, energias de ligação calculadas e dinâmicas moleculares simuladas. Pretendemos obter informações sobre a diversidade de sequências, motivos funcionais, identificação de alvos, estados conformacionais e filogenia de bacteriocinas e bactérias produtoras, a fim de propor modificações estruturais para o aprimoramento da atividade antimicrobiana. Assim, esses peptídeos estudados podem ajudar a economizar recursos e proporcionar maior eficiência no combate a patógenos relevantes para a indústria de alimentos e saúde pública. Isso representa um passo notável na busca por aplicações probióticas, visando melhorar a qualidade dos alimentos e a saúde global

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