Análise genômica, transcriptômica e caracterização fenotípica de linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de diferentes fontes no Brasil

• Processo: 23/16616-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
• Pesquisador responsável: Juliana Pfrimer Falcão
• Beneficiário: Giovana do Nascimento Pereira
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 25/14517-2 - Estratégias baseadas em bacteriófagos para controle de linhagens de Campylobacter multirresistentes e formadoras de biofilme, BE.EP.DR
• Assunto(s): Campylobacter jejuni Transcriptoma Bacteriologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Campylobacter jejuni | membrana corioalantóica de embrião de galinha | Sequenciamento do genoma completo | Testes fenotípicos relacionados à virulência e sobrevivência | Transcriptoma | Bacteriologia

Resumo

A campilobacteriose é uma das principais doenças diarreiogênicas em diferentes países. A espécie Campylobacter jejuni é responsável por aproximadamente 90% dessas infecções em humanos, e a carne de aves é o principal veículo de sua transmissão. No Brasil, o estudo e o isolamento de C. jejuni são reportados com menor frequência, o que dificulta a avaliação da importância e da dimensão desse patógeno no nosso país. Assim, esse projeto tem como objetivos analisar comparativamente por meio do sequenciamento do genoma completo, sequenciamento do transcriptoma e por testes fenotípicos relacionados à virulência e sobrevivência, linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de fontes diversas ao longo de 27 anos no Brasil. A análise comparativa do genoma completo sequenciado será realizada para 140 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (n=49), animais (n=50), alimentos (n=41) pela pesquisa da presença de ilhas de patogenicidade, presença de plasmídeos, ilhas metabólicas, cgMLST, ANI, pangenoma, análise das sequencias espaçadoras do sistema CRISPR, predição de genes que codificam Transducer like proteins e abordagem de vacinologia reversa para a predição de possíveis alvos vacinais. Para 60 linhagens selecionadas serão realizados os testes fenotípicos de tolerância ao congelamento e à pasteurização, formação de biofilme e sobrevivência ao ácido peracético. Ademais, para 30 linhagens a serem selecionadas será realizado ensaio de sobrevivência em co-cultivo com Salmonella sp. e ensaio in vivo utilizando-se membrana corioalantóica de embrião de galinha. Por fim, será feita a análise do transcriptoma de uma linhagem de C. jejuni submetida ao modelo colônico in vitro SEMH®. Os resultados a serem obtidos no presente trabalho deverão contribuir para uma melhor caracterização fenotípica e molecular de C. jejuni, fornecendo informações inéditas e de extrema relevância sobre as possíveis diferenças na patogenicidade, virulência, possíveis alvos vacinais e diversidade genotípica de linhagens isoladas de humanos, animais e alimentos durante 27 anos no Brasil.