Caracterização da via de reparo de DNA por FAN1 em Pseudomonas aeruginosa

• Processo: 24/03230-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2029
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Rodrigo da Silva Galhardo
• Beneficiário: Henrique Kustor Antonini
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3), AP.CEPID
• Assunto(s): Pseudomonas aeruginosa Reparo do DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: FANCD2-associated nuclease 1 | Fanci | Ligações cruzadas interfitas (ICL) | Pseudomonas aeruginosa | reparo de DNA | Reparo de DNA

Resumo

Pseudomonas aeruginosa é uma bactéria patogênica considerada de prioridade crítica pela OMS para pesquisa e desenvolvimento de novos antibióticos. Estudos identificaram neste importante microrganismo a proteína FAN1, um homólogo da enzima humana de reparo de DNA, e caracterizaram a sua atividade in vitro no reparo de lesões do tipo ligação cruzada interfita, porém, a importância in vivo e demais aspectos de sua função no contexto bacteriano não foram estudados. A literatura demonstra que a FAN1 humana atua em pelo menos duas vias independentes, a da anemia de Fanconi e de mismatch repair, e que mutações em seu gene estão relacionadas a nefrite intersticial cariomegálica, doença de Huntington e predisposição a câncer, no entanto, diversos aspectos da sua atividade in vivo ainda precisam ser elucidados. P. aeruginosa apresenta FAN1 codificada em operon com PA1866, uma proteína de função desconhecida a qual apresenta homologia com DNA helicases como a FANCJ humana, que participa das mesmas vias que FAN1, e também um domínio semelhante a nucleases da família Cas4. Através deste projeto iremos caracterizar as vias de reparo de DNA envolvendo FAN1 e PA1866 em P. aeruginosa. Para tanto, pretendemos testar a sua regulação como parte da resposta SOS, identificar os agentes genotóxicos e mutagênicos contra os quais conferem proteção, descrever suas interações genéticas e proteicas, estudar possíveis assinaturas mutacionais e ainda verificar sua participação na recombinação homóloga. Com os resultados obtidos esperamos não só caracterizar de forma inédita a importância destas enzimas e suas vias no reparo de DNA em procariotos, mas também auxiliar os estudos de seus homólogos humanos.